羅氏旗下454生命科學(xué)推出GS FLX Titanium系列試劑有效取代傳統(tǒng)的Sanger測序
羅氏旗下454生命科學(xué)公司宣布推出全新的GS FLX Titanium系列試劑和軟件，它們將改變生命科學(xué)行業(yè)。利用新的試劑，升級的Q20單個(gè)序列讀長達(dá)到400個(gè)堿基對（即第400個(gè)堿基的準(zhǔn)確率也高達(dá)99%，前面的堿基準(zhǔn)確率更高）；通量提高5倍，達(dá)到每輪運(yùn)行能獲得4-6億個(gè)堿基對序列。產(chǎn)品性能提升到新高度，進(jìn)一步鞏固了454生命科學(xué)公司在測序領(lǐng)域作為金標(biāo)準(zhǔn)的地位，在大多數(shù)應(yīng)用中有效取代了傳統(tǒng)的Sanger測序法。
北美多個(gè)主流基因組研究中心增加該儀器的配置數(shù)量正是響應(yīng)儀器性能提升的結(jié)果。貝勒醫(yī)學(xué)院是第一個(gè)安裝了10臺Genome Sequencer FLX儀器的機(jī)構(gòu)，圣路易斯的華盛頓大學(xué)緊隨其后也立刻將FLX增加至8臺。麻省理工大學(xué)和哈佛大學(xué)合作的Broad研究院目前的儀器數(shù)量是10臺，聯(lián)合基因組研究院（Joint Genome Institute）也增至8臺FLX。
首批GS FLX Titanium系列試劑盒在今年早期運(yùn)送至這些基因組中心以進(jìn)行測試和評估。針對這些試劑和軟件表現(xiàn)的反饋意見都非常滿意,充分肯定了新系統(tǒng)的強(qiáng)大實(shí)力。實(shí)際上，幾個(gè)主要的基因組中心已經(jīng)將GS FLX Titanium試劑運(yùn)用于生產(chǎn)中。貝勒醫(yī)學(xué)院人類基因組測序中心的主管Richard Gibbs教授表示：“我們很高興能第一個(gè)優(yōu)先使用GS FLX Titanium試劑，也非常滿意----新試劑的性能與454承諾的一樣好。新的試劑有效取代了Sanger測序，因此我們正將其應(yīng)用到我們中心10臺GS FLX儀器上�！�
麻省理工大學(xué)和哈佛大學(xué)聯(lián)合的Broad研究院的基因組生物計(jì)劃也是新試劑的早期用戶之一。該計(jì)劃的聯(lián)合主管Chad Nusbaum博士如此評價(jià)：“我們對新的GS FLXTitanium試劑系列的潛能非常樂觀，它能降低費(fèi)用并提高測序質(zhì)量。這個(gè)系統(tǒng)將有助于我們擴(kuò)展研究范圍，實(shí)施以前覺得成本過于昂貴的項(xiàng)目。我們正在開發(fā)新方法來充分利用這個(gè)全新的長達(dá)400個(gè)堿基對的序列讀長能力，尤其是用于大型基因組的重新拼接�！�
“我們用長的GS FLX Titanium序列讀長能力來對果蠅進(jìn)行拼接，效果也非常好。利用454生命科學(xué)獨(dú)特的3K和20K配對末端讀序法，我們的N50 contig長度達(dá)到30-50kb，N50 scaffold的大小也超過3 Mb, 基因組的序列覆蓋度為12倍�！必惱蔗t(yī)學(xué)院人類基因組測序中心的助理教授Stephen Richards博士表示, “與對照的果蠅基因組相比，這個(gè)結(jié)果非常好，說明GS FLX Titanium系列讀長至少相當(dāng)于Sanger讀長的8倍，
而速度卻快得多，費(fèi)用也少了一個(gè)數(shù)量級�！�
Broad研究院測序部門的主管Rob Nicol博士補(bǔ)充道，“除了長達(dá)400bp的序列讀長和更高的測序讀長密度，新Titanium系列的改進(jìn)有助于開發(fā)更高效、更高通量的工作流程，以應(yīng)用于大規(guī)模測序工作中----例如人類微生物組計(jì)劃（HMP）中的微生物全基因組測序。GS FLX Titanium系列的高效步驟讓我們簡化了工作流程，大大縮短了從樣品到數(shù)據(jù)再到結(jié)果的時(shí)間�！�
為GS FLX Titanium系列試劑的推出作準(zhǔn)備，更多的客戶應(yīng)邀參與了早期試用計(jì)劃�？巳R格凡特研究院（J. Craig Venter Institute, JCVI）核心技術(shù)開發(fā)與服務(wù)的副總裁Yu-Hui Rogers博士表示，“我們用GS FLX Titanium系列試劑進(jìn)行的初期驗(yàn)證結(jié)果是非常令人鼓舞。一旦這些試劑推出，序列讀長和產(chǎn)能的提升將促使我們立即將新產(chǎn)品投入使用。新的試劑，以及從不同大小的插入片段文庫中獲得配對末端序列讀長的能力，將大大提升454系統(tǒng)在JCVI幾個(gè)重要測序應(yīng)用中的作用，包括人類重測序和代謝基因組測序。”
454生命科學(xué)的CEO兼總裁Chris McLeod表示：“我們很高興能為迅速擴(kuò)大的客戶群提供GS FLX Titanium系列試劑。GS FLX系統(tǒng)正迅速成為DNA測序的金標(biāo)準(zhǔn)，它與傳統(tǒng)的Sanger測序和許多所謂的微讀長技術(shù)相比，性能、準(zhǔn)確性、價(jià)格的優(yōu)勢顯而易見�！�
無需對儀器的硬件做任何改動(dòng)，僅僅改進(jìn)試劑和軟件，就能實(shí)現(xiàn)技術(shù)性能提升。因此，目前使用GS FLX儀器的客戶不需要任何昂貴的儀器升級，即可利用和享受到這些改進(jìn)。454生命科學(xué)研發(fā)部的副總裁Michael Egholm認(rèn)為：“我們很自豪能為科學(xué)家提供這樣卓越的性能升級。聯(lián)合基因組研究院現(xiàn)在單次運(yùn)行就能得到超過6.5億個(gè)堿基。我們的平臺能讓科學(xué)家迅速獲得有意義的結(jié)果，這一點(diǎn)從頂級學(xué)術(shù)期刊發(fā)表文章的驚人比例中也能看出。新的GS FLX Titanium系列試劑無以倫比的性能提升已經(jīng)被市場認(rèn)可，而毛細(xì)管測序儀正慢慢地被淘汰，客戶也逐漸轉(zhuǎn)向454測序平臺。”
北美多個(gè)主流基因組研究中心增加該儀器的配置數(shù)量正是響應(yīng)儀器性能提升的結(jié)果。貝勒醫(yī)學(xué)院是第一個(gè)安裝了10臺Genome Sequencer FLX儀器的機(jī)構(gòu)，圣路易斯的華盛頓大學(xué)緊隨其后也立刻將FLX增加至8臺。麻省理工大學(xué)和哈佛大學(xué)合作的Broad研究院目前的儀器數(shù)量是10臺，聯(lián)合基因組研究院（Joint Genome Institute）也增至8臺FLX。
首批GS FLX Titanium系列試劑盒在今年早期運(yùn)送至這些基因組中心以進(jìn)行測試和評估。針對這些試劑和軟件表現(xiàn)的反饋意見都非常滿意,充分肯定了新系統(tǒng)的強(qiáng)大實(shí)力。實(shí)際上，幾個(gè)主要的基因組中心已經(jīng)將GS FLX Titanium試劑運(yùn)用于生產(chǎn)中。貝勒醫(yī)學(xué)院人類基因組測序中心的主管Richard Gibbs教授表示：“我們很高興能第一個(gè)優(yōu)先使用GS FLX Titanium試劑，也非常滿意----新試劑的性能與454承諾的一樣好。新的試劑有效取代了Sanger測序，因此我們正將其應(yīng)用到我們中心10臺GS FLX儀器上�！�
麻省理工大學(xué)和哈佛大學(xué)聯(lián)合的Broad研究院的基因組生物計(jì)劃也是新試劑的早期用戶之一。該計(jì)劃的聯(lián)合主管Chad Nusbaum博士如此評價(jià)：“我們對新的GS FLXTitanium試劑系列的潛能非常樂觀，它能降低費(fèi)用并提高測序質(zhì)量。這個(gè)系統(tǒng)將有助于我們擴(kuò)展研究范圍，實(shí)施以前覺得成本過于昂貴的項(xiàng)目。我們正在開發(fā)新方法來充分利用這個(gè)全新的長達(dá)400個(gè)堿基對的序列讀長能力，尤其是用于大型基因組的重新拼接�！�
“我們用長的GS FLX Titanium序列讀長能力來對果蠅進(jìn)行拼接，效果也非常好。利用454生命科學(xué)獨(dú)特的3K和20K配對末端讀序法，我們的N50 contig長度達(dá)到30-50kb，N50 scaffold的大小也超過3 Mb, 基因組的序列覆蓋度為12倍�！必惱蔗t(yī)學(xué)院人類基因組測序中心的助理教授Stephen Richards博士表示, “與對照的果蠅基因組相比，這個(gè)結(jié)果非常好，說明GS FLX Titanium系列讀長至少相當(dāng)于Sanger讀長的8倍，
而速度卻快得多，費(fèi)用也少了一個(gè)數(shù)量級�！�
Broad研究院測序部門的主管Rob Nicol博士補(bǔ)充道，“除了長達(dá)400bp的序列讀長和更高的測序讀長密度，新Titanium系列的改進(jìn)有助于開發(fā)更高效、更高通量的工作流程，以應(yīng)用于大規(guī)模測序工作中----例如人類微生物組計(jì)劃（HMP）中的微生物全基因組測序。GS FLX Titanium系列的高效步驟讓我們簡化了工作流程，大大縮短了從樣品到數(shù)據(jù)再到結(jié)果的時(shí)間�！�
為GS FLX Titanium系列試劑的推出作準(zhǔn)備，更多的客戶應(yīng)邀參與了早期試用計(jì)劃�？巳R格凡特研究院（J. Craig Venter Institute, JCVI）核心技術(shù)開發(fā)與服務(wù)的副總裁Yu-Hui Rogers博士表示，“我們用GS FLX Titanium系列試劑進(jìn)行的初期驗(yàn)證結(jié)果是非常令人鼓舞。一旦這些試劑推出，序列讀長和產(chǎn)能的提升將促使我們立即將新產(chǎn)品投入使用。新的試劑，以及從不同大小的插入片段文庫中獲得配對末端序列讀長的能力，將大大提升454系統(tǒng)在JCVI幾個(gè)重要測序應(yīng)用中的作用，包括人類重測序和代謝基因組測序。”
454生命科學(xué)的CEO兼總裁Chris McLeod表示：“我們很高興能為迅速擴(kuò)大的客戶群提供GS FLX Titanium系列試劑。GS FLX系統(tǒng)正迅速成為DNA測序的金標(biāo)準(zhǔn)，它與傳統(tǒng)的Sanger測序和許多所謂的微讀長技術(shù)相比，性能、準(zhǔn)確性、價(jià)格的優(yōu)勢顯而易見�！�
無需對儀器的硬件做任何改動(dòng)，僅僅改進(jìn)試劑和軟件，就能實(shí)現(xiàn)技術(shù)性能提升。因此，目前使用GS FLX儀器的客戶不需要任何昂貴的儀器升級，即可利用和享受到這些改進(jìn)。454生命科學(xué)研發(fā)部的副總裁Michael Egholm認(rèn)為：“我們很自豪能為科學(xué)家提供這樣卓越的性能升級。聯(lián)合基因組研究院現(xiàn)在單次運(yùn)行就能得到超過6.5億個(gè)堿基。我們的平臺能讓科學(xué)家迅速獲得有意義的結(jié)果，這一點(diǎn)從頂級學(xué)術(shù)期刊發(fā)表文章的驚人比例中也能看出。新的GS FLX Titanium系列試劑無以倫比的性能提升已經(jīng)被市場認(rèn)可，而毛細(xì)管測序儀正慢慢地被淘汰，客戶也逐漸轉(zhuǎn)向454測序平臺。”
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