基于癌癥 Cytogenomics 芯片協(xié)會(huì)的設(shè)計(jì)

2011 年 10 月，蒙特利爾——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日發(fā)布 SurePrint G3 CGH+SNP 癌癥目錄芯片，該款芯片能夠在同一實(shí)驗(yàn)中檢測(cè)出癌癥組織樣本中的拷貝數(shù)和中性拷貝變異，將極大地滿足研究人員日益增長(zhǎng)的此類需求。

安捷倫發(fā)布芯片的同時(shí)還發(fā)布了 CytoGenomics 2.0 軟件，該款軟件用于支持對(duì)遺傳學(xué)復(fù)雜的樣本，例如血液類癌癥樣本進(jìn)行 CGH+SNP 分析。

這款新型芯片是基于癌癥 Cytogenomics 芯片協(xié)會(huì)的設(shè)計(jì)，連同安捷倫世界一流的 CGH+SNP 芯片與 ISCA 芯片一起，成為細(xì)胞遺傳學(xué)研究中不可或缺的重要工具。

貝勒醫(yī)學(xué)院人類分子遺傳學(xué)教授 Marilyn M. Li 說道：“癌癥遺傳學(xué)領(lǐng)域迫切需要一個(gè)兼具 CGH 和 SNP 微陣列所有優(yōu)勢(shì)的平臺(tái)。整合后的 CGH-SNP 平臺(tái)能夠檢測(cè)基因組上中性拷貝數(shù)變異，拷貝數(shù)擴(kuò)增、雜合性缺失以及在單核苷酸多態(tài)性（SNP）沙漠區(qū)域的拷貝數(shù)變異。包含 SNP 探針的CGH 微陣列，能夠提高檢測(cè)低比例嵌合現(xiàn)象的準(zhǔn)確度，還有助于測(cè)定癌癥基因組的倍體形式�；�于SNP 探針提供的等位基因信息具有極其重要意義。例如，SNP 等位基因譜有助于區(qū)分哪些是真正的高亞二倍體，哪些是亞二倍體的復(fù)制，從而深入了解疾病演化。”

安捷倫基因組學(xué)高級(jí)營(yíng)銷總監(jiān) Kathleen Shelton 談到：“多年來，我們的雙色 CGH 芯片平臺(tái)廣泛用于癌癥研究，發(fā)表的論文多達(dá)幾百篇。我們非常自豪地推出這款芯片，它融入了中性拷貝數(shù)雜合性缺失（LOH） 分析功能，能夠獲得與拷貝數(shù)數(shù)據(jù)同等準(zhǔn)確的結(jié)果，在同款芯片上實(shí)現(xiàn)了5-Mb 的 LOH 分辨率�！�

安捷倫同時(shí)發(fā)布了 CytoGenomics 2.0 軟件，芯片用戶可免費(fèi)獲得，用于對(duì) SurePrint CGH+SNP 癌癥芯片實(shí)驗(yàn)得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。CytoGenomics 2.0 軟件采用新的算法，能夠分析基因組復(fù)雜的樣本（常見于拷貝數(shù)變異導(dǎo)致的癌癥）、腫瘤異質(zhì)性樣本、腫瘤細(xì)胞和正常細(xì)胞的混合樣本。

除了目錄芯片，安捷倫還提供 SurePrint G3 CGH+SNP 癌癥芯片簡(jiǎn)單定制的功能。通過安捷倫 eArray 在線設(shè)計(jì)工具，用戶可在 65,000 個(gè)SNP探針以及 2800 萬個(gè)預(yù)審的 CGH 探針中隨意選擇。

這些新產(chǎn)品進(jìn)一步擴(kuò)充了安捷倫種類齊全的基因組解決方案大軍，包括 Bravo 自動(dòng)化液體處理平臺(tái)、新一代 SureScan 芯片掃描儀、各種試劑以及生物信息學(xué)軟件。安捷倫還就世界一流的 SureSelect XT 靶向序列捕獲系統(tǒng)為進(jìn)行新一代測(cè)序提供完善的樣品制備工作流程。

要了解更多信息，請(qǐng)?jiān)L問 www.agilent.com/genomics/cgh_snp。