肝臟是一個重要的代謝器官，它在脂類合成、降解以及轉運過程中都發(fā)揮著極其重要的作用，然而，雞的脂類代謝的分子調(diào)控機制至今仍不清楚。本研究采用RNA測序技術探討了青年雞與產(chǎn)蛋雞肝臟脂類代謝相關基因間的表達差異，結果表明，與青年雞相比，產(chǎn)蛋雞在轉錄水平發(fā)生變化的基因大多與脂肪代謝有關，同時發(fā)現(xiàn)了一批新的基因以及可變剪接體，它們的功能也可能與肝臟脂肪代謝相關，但還需進一步加以驗證。本研究提供了產(chǎn)蛋雞肝臟表達譜的重要信息，為進一步深入研究雞肝臟脂質代謝分子機制，以及提高家禽產(chǎn)蛋性能和肉質品質奠定了基礎。該研究中RNA-Seq服務由上海伯豪生物技術有限公司提供。

研究思路


研究結果

1. 青年雞與產(chǎn)蛋雞肝臟表達譜差異。以青年雞（n=3）和產(chǎn)蛋雞（n=）的肝臟總RNA為測序分析基礎。與青年雞相比，在產(chǎn)蛋雞中共有2567個差異表達基因（其中1082個基因上調(diào)，1485個基因下調(diào)），其中有960個基因的表達差異極顯著且相差2倍以上。
2. 新基因和新的可變剪接體。發(fā)現(xiàn)了198個表達差異極顯著的新基因，其中的大多數(shù)（91個上調(diào)，107個下調(diào)）都高效表達，并且確定了332個表達差異極顯著基因的可變剪接體。
3. 生物過程分析。表達差異極顯著的基因中最顯著的GO分析包括脂質合成、膽固醇和甾醇的代謝和氧化還原，表明脂肪生成主要在產(chǎn)蛋雞的肝臟中進行。
4. 通路分析。GO富集和KEGG通路分析表明，表達差異極顯著基因大多數(shù)富集在類固醇生物合成、PPAR信號通路、不飽和脂肪酸的生物合成、甘油磷脂代謝、三大氨基酸通路以及丙酮酸代謝途徑。

原文出處:

Hong Li, Taian Wang, Chunlin Xu, Dandan Wang, Junxiao Ren, Yanmin Li, Yadong Tian, Yanbin Wang, Yuping Jiao, Xiangtao Kang, and Xiaojun Liu. Transcriptome profile of liver at different physiological stages reveals potential mode for lipid metabolism in laying hens. BMC Genomics. 2015, 16:763