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賽默飛HRMS1-DIA方案亮相蛋白質(zhì)組學(xué)學(xué)術(shù)研討會!

瀏覽次數(shù):8446 發(fā)布日期:2019-5-29  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
高通量、高準(zhǔn)確 | 賽默飛HRMS1-DIA方案驚艷亮相臨床蛋白質(zhì)組學(xué)和糖組學(xué)學(xué)術(shù)研討會!
 
5月26日,CNHUPO|臨床蛋白質(zhì)組學(xué)和糖組學(xué)學(xué)術(shù)研討會于上海勝利閉幕。此次研討會,諸多蛋白組學(xué)和糖組學(xué)專家闡述了組學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)/臨床研究中的應(yīng)用,為未來從研究到臨床轉(zhuǎn)化探討了新的思路,開拓了更加廣闊的應(yīng)用前景。
 
北京生命科學(xué)研究院邵峰院士
 
報告題目:Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond
 
報告主要內(nèi)容:
大會由復(fù)旦大學(xué)陸豪杰教授致開幕詞,北京生命科學(xué)研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond”的報告,明晰了細(xì)胞焦亡與傳統(tǒng)細(xì)胞凋亡的區(qū)別,闡述了分子免疫機(jī)制:Caspase-4/5/11作為胞內(nèi)LPS的受體,識別LPS的Lipid A部分,進(jìn)而發(fā)生寡聚化而激活。這些細(xì)菌免疫受體活化后,均通過誘導(dǎo)組裝炎癥小體復(fù)合物進(jìn)而激活膜打孔蛋白GSDMD,誘發(fā)細(xì)胞焦亡。
 

 
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院副院長楊芃原教授
 
報告題目:疾病糖蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜
 
報告主要內(nèi)容:
從質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展歷史,到質(zhì)譜如何幫助蛋白組學(xué)研究,再到質(zhì)譜技術(shù)未來向臨床發(fā)展的展望:以MRM為基礎(chǔ)的質(zhì)譜ELISA技術(shù)可以在臨床檢驗中逐步部分取代現(xiàn)有傳統(tǒng)ELISA,特別是檢驗具有群和網(wǎng)絡(luò)特征的關(guān)鍵蛋白。同時,運(yùn)用Orbitrap技術(shù)的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。
 
 
 
國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京秦鈞主任
 
報告題目:胃癌的臨床蛋白組學(xué)研究
 
報告主要內(nèi)容:
從蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用于臨床所面臨的問題,到未來蛋白質(zhì)組學(xué)走向臨床的前景,秦鈞教授通過一些臨床研究實例,講述了如何在實踐中逐步克服臨床生物樣本、檢測手段等方面的局限性,描繪了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動轉(zhuǎn)化臨床的可行性。尤其是惡性腫瘤化療藥物靶點(diǎn)、免疫治療標(biāo)志物、治療響應(yīng)性標(biāo)志物等,有望應(yīng)用于臨床伴隨診斷。無論是在探索分子病理方面,抑或是實現(xiàn)臨床早診、治療領(lǐng)域,蛋白質(zhì)組學(xué)都發(fā)揮著越來越重要的作用。蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動的精準(zhǔn)醫(yī)療時代(Proteomics-driven precision medicine)已經(jīng)被開啟。
 
 
 
同濟(jì)大學(xué)田志新教授
 
報告題目:基于糖蛋白質(zhì)組學(xué)的癌癥和癌癥干細(xì)胞生物標(biāo)志物的分析
 
報告主要內(nèi)容:
同濟(jì)大學(xué)田志新教授,做了在肝癌、乳腺癌研究中發(fā)現(xiàn)N-糖蛋白質(zhì)標(biāo)志物的報告,結(jié)合ZIC-HILIC富集、同位素二甲基標(biāo)記、pentaHILIC-nESI-MS/MS(HCD,stepped NCEs)、GPseeker定性、GPseekerQuan定量,對HCC HepG2細(xì)胞中差異表達(dá)N-糖基化在完整水平上進(jìn)行大規(guī)模位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)特異性的分離、鑒定和定量。
 
 
 
西湖大學(xué)郭天南教授
 

 
西湖大學(xué)的郭天南教授介紹了運(yùn)用DIA技術(shù)結(jié)合PCT快速樣品前處理技術(shù)在臨床大隊列樣本研究中的應(yīng)用,以及使用Orbitrap技術(shù)平臺建立人類多個組織蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫,為DIA和PRM分析提供便利。
 
賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關(guān)注
 
 
大會報告中賽默飛應(yīng)用經(jīng)理周岳,帶來HRMS1-DIA技術(shù)在臨床大樣本蛋白質(zhì)組學(xué)分析中的可行性評價:
 
經(jīng)過來自9個國家和地區(qū)的11個實驗室,連續(xù)7天24小時運(yùn)行,基于HRMS1-DIA工作流表現(xiàn)出長期運(yùn)行中保持極高的穩(wěn)定性,在不同儀器及實驗室間產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也有極佳的重現(xiàn)性以及提供蛋白質(zhì)組學(xué)準(zhǔn)確定量結(jié)果。HRMS1-DIA工作流可對精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究中的大隊列生物樣品進(jìn)行高通量和深度的蛋白質(zhì)組定量。
 
HRMS1-DIA方案優(yōu)勢:
 
1、相對傳統(tǒng)DIA的二級碎片離子定量,基于超高分辨一級全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數(shù)量和準(zhǔn)確性都有顯著提高(蛋白鑒定數(shù)目提高10%,CV<10%)
2、在HRMS1-DIA工作流正常運(yùn)行的狀態(tài)下,全部11個實驗室,平均可以鑒定到超過8000個蛋白(1% protein FDR),定量超過6000個蛋白。
3、在定量準(zhǔn)確性方面,在1小時定量6000個蛋白,50000個肽段的超高通量下,HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準(zhǔn)確性。
4、超高80%的蛋白可以在每天、每個實驗室定量。
 
賽默飛HRMS1-DIA方案對于蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床轉(zhuǎn)化具有極為廣泛的參考價值,超高的穩(wěn)定性、日間重復(fù)性成為臨床研究領(lǐng)域用戶最值得期待的技術(shù)。
相關(guān)公司:賽默飛世爾科技(色譜與質(zhì)譜)
聯(lián)系電話:13386161207
E-mail:ping.shen2@thermofisher.com


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