▪全面的基因組覆蓋范圍：檢測(cè)> 935,000個(gè)CpG位點(diǎn)，全面覆蓋CpG島、啟動(dòng)子、編碼區(qū)及增強(qiáng)子。
▪探針位點(diǎn)的全面優(yōu)化：在EPICv1.0-850K的基礎(chǔ)上去除了性能不佳的探針，新增186,000個(gè)CpG靶向增強(qiáng)子和超級(jí)增強(qiáng)子、更多CTCF結(jié)合位點(diǎn)、CNV檢測(cè)區(qū)域、EPIC v1.0覆蓋不足的CpG島以及常見癌癥驅(qū)動(dòng)突變。
▪兼容多種樣本類型：包括FFPE、新鮮/冷凍組織、全血、口腔細(xì)胞、cfDNA、唾液和其他樣本類型。
▪高質(zhì)量的數(shù)據(jù)：沿用了450K芯片的Infinium技術(shù)，同時(shí)采用Infinium I及II探針設(shè)計(jì)，使檢測(cè)范圍最大化。
▪分辨率高：單堿基分辨率，可以直接檢測(cè)到發(fā)生甲基化的準(zhǔn)確位點(diǎn)。
▪可重復(fù)性高：自身技術(shù)重復(fù)間的相關(guān)性以及與850K相同探針間的相關(guān)性R²>0.99。
▪注釋信息：人參考基因組版本更新到hg38，GenCode數(shù)據(jù)庫更新到v41版本。
 

935K與850K芯片數(shù)據(jù)相關(guān)性

935K甲基化芯片檢測(cè)能夠檢測(cè)到0.2的beta值差異，假陽性率低于1%，從而實(shí)現(xiàn)了較高的分析靈敏度，同時(shí)也具有極好的數(shù)據(jù)可重現(xiàn)性。如下圖（A）935K芯片技術(shù)重復(fù)相關(guān)性R²>0.99；（B）935K芯片和850K的交集探針間的相關(guān)性R²>0.99；（C）935K芯片數(shù)據(jù)與甲基化測(cè)序（100×測(cè)序深度）的相關(guān)性R²>96%。

935K芯片實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)展示

嚴(yán)格按照Illumina Infinium® MethylationEPICv2 BeadChip(簡稱935K)操作手冊(cè)完成DNA抽提、轉(zhuǎn)化、擴(kuò)增、雜交洗脫等，質(zhì)控結(jié)果說明雜交實(shí)驗(yàn)過程穩(wěn)定、轉(zhuǎn)化率高、熒光信號(hào)和結(jié)合狀況良好，綜合說明實(shí)驗(yàn)操作穩(wěn)定，可以進(jìn)一步做甲基化的數(shù)據(jù)分析。 

關(guān)于伯豪生物
伯豪生物已累計(jì)為客戶完成千余例表觀遺傳科研服務(wù)項(xiàng)目，涉及組織、細(xì)胞、全血、FFPE、唾液、ctDNA等各種實(shí)驗(yàn)樣本數(shù)萬例，涵蓋腫瘤、胚胎發(fā)育、復(fù)雜疾病等各個(gè)領(lǐng)域，伯豪生物客戶使用甲基化芯片、甲基化捕獲測(cè)序（MC-seq）、全基因組甲基化測(cè)序（WGBS）、m6A-seq和焦磷酸測(cè)序等甲基化研究技術(shù)分別在Theranostics、ACS Nano、Front Cell Dev Biol.、PNAS、Ann Rheum Di等期刊發(fā)表論文。