熒光劑與熒光顯微鏡配合使用,可觀察標(biāo)本中的特定細(xì)胞成分。試劑可以是熒光染料(如 ATTO Rho6G(羅丹明))、熒光蛋白(如 GFP(綠色))或免疫熒光染色劑(如 ATTO 488-抗體共軛物)。熒光蛋白在相關(guān)細(xì)胞蛋白中表達(dá)與遺傳相關(guān)。它們通常用于研究活細(xì)胞。在某些情況下,熒光蛋白會導(dǎo)致有關(guān)細(xì)胞蛋白的功能障礙或誤解。如果蛋白質(zhì)克隆不可能或不切實(shí)際,例如涉及組織學(xué)標(biāo)本,則可使用免疫熒光染色等技術(shù)來觀察感興趣的細(xì)胞蛋白質(zhì)。為此,
抗體與不同的熒光染料相連,以便直接或間接地與目標(biāo)結(jié)構(gòu)結(jié)合。甚至還有針對特定應(yīng)用的活細(xì)胞染料品種,可以觀察細(xì)胞器,如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)、線粒體和高爾基體。還有一些功能測試可對活細(xì)胞進(jìn)行標(biāo)記,以跟蹤細(xì)胞增殖和凋亡等過程,以及區(qū)分活細(xì)胞和死細(xì)胞(活/死檢測)。即使是非生物物質(zhì),如細(xì)胞中的鈣(Ca)離子,也可以用熒光鈣指示劑來檢測。
主要經(jīng)驗(yàn)
- 熒光顯微鏡可使用多種染料來研究生物標(biāo)本并觀察特定的細(xì)胞成分。
- 科學(xué)家可以利用點(diǎn)擊化學(xué)的優(yōu)勢,使用非天然氨基酸與抗體和納米抗體對生物大分子進(jìn)行正交熒光標(biāo)記。
- 有許多熒光染料可供使用。例如:與熒光標(biāo)記抗體結(jié)合的染料、FITC 和 TRITC、ATTO 染料、DNA/RNA 染色劑(如 DAPI 和 Hoechst 染料)、用于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)染色的 DiOC6(3)、用于離子成像的 fura-2、fluor-3、鈣綠、SBFI 和 PDFI,以及用于功能檢測的 ATTO 染色試劑盒。
- 如列表所示,每種染料在激發(fā)光譜和發(fā)射光譜中都有一個明顯的峰值。當(dāng)同時使用幾種染料時,如用于多重分析和空間生物學(xué),必須了解激發(fā)光譜和發(fā)射光譜的重疊會導(dǎo)致錯誤的陰性或陽性結(jié)果,或使數(shù)據(jù)模糊不清。
本文將介紹常用的熒光染料并概述其特性。熒光顯微鏡借助熒光染料、熒光蛋白或使用抗體的免疫熒光染色來研究特定的細(xì)胞成分。由于熒光劑種類繁多,熒光顯微鏡可用于檢查蛋白質(zhì)、核酸、聚糖、細(xì)胞器和其他細(xì)胞結(jié)構(gòu)。
熒光染料和顯微鏡
熒光劑與熒光顯微鏡配合使用,可觀察標(biāo)本中的特定細(xì)胞成分。試劑可以是熒光染料(如 ATTO Rho6G(羅丹明))、熒光蛋白(如 GFP(綠色))或免疫熒光染色劑(如 ATTO 488-抗體共軛物)。
熒光蛋白通過基因連接,在相關(guān)細(xì)胞蛋白中表達(dá)[1]。它們通常用于研究活細(xì)胞。在某些情況下,熒光蛋白會導(dǎo)致有關(guān)細(xì)胞蛋白的功能障礙或誤解。如果蛋白質(zhì)克隆不可能或不切實(shí)際,例如涉及組織學(xué)標(biāo)本,則可使用免疫熒光染色等技術(shù)來觀察感興趣的細(xì)胞蛋白質(zhì)。為此,抗體與不同的熒光染料相連,以便直接或間接地與目標(biāo)結(jié)構(gòu)結(jié)合。甚至還有針對特定應(yīng)用的活細(xì)胞染料品種,可以觀察細(xì)胞器,如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)、線粒體和高爾基體。還有一些功能測試可對活細(xì)胞進(jìn)行標(biāo)記,以跟蹤細(xì)胞增殖和凋亡等過程,以及區(qū)分活細(xì)胞和死細(xì)胞(活/死檢測)。即使是非生物物質(zhì),如細(xì)胞中的鈣(Ca)離子,也可以用熒光鈣指示劑來檢測。下文概述了最常用的熒光染料。
利用點(diǎn)擊化學(xué)進(jìn)行熒光標(biāo)記
一般來說,
"點(diǎn)擊化學(xué) "利用的是無有害副產(chǎn)物、化學(xué)收率高和產(chǎn)物穩(wěn)定的化學(xué)反應(yīng) [2]。科學(xué)家可以利用點(diǎn)擊化學(xué)來開發(fā)化學(xué)反應(yīng),通過將小單元連接在一起,快速可靠地生成物質(zhì)。這使他們能夠使用非天然氨基酸 (UAA) 對生物大分子與抗體和納米抗體進(jìn)行正交熒光標(biāo)記。ATTO-TEC 和其他公司生產(chǎn)的疊氮和炔烴官能化染料可用于點(diǎn)擊化學(xué)應(yīng)用 [3]。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)的例子包括銅催化的 Huisgen 疊氮烷烴環(huán)化反應(yīng),在染料和目標(biāo)分子之間形成三唑連接;以及作為點(diǎn)擊試劑的 DBCO 衍生物染料,用于無催化、應(yīng)變促進(jìn)的疊氮烷烴環(huán)化反應(yīng) [3]。
免疫熒光染料
通過熒光標(biāo)記抗體與細(xì)胞中特定的相關(guān)蛋白質(zhì)結(jié)合,就可以用熒光顯微鏡對這些蛋白質(zhì)進(jìn)行研究。就組織學(xué)標(biāo)本而言,無法使用熒光蛋白,因?yàn)闃?biāo)本一般來自不表達(dá)任何熒光蛋白的生物體。此外,如果有有效的抗體,使用免疫熒光技術(shù)比熒光蛋白技術(shù)要快得多。
免疫熒光利用了抗體與抗原的特異性結(jié)合親和力。它采用了兩種不同的方法。
直接免疫熒光是最簡單的方法,它將熒光標(biāo)記的抗體直接與感興趣的蛋白質(zhì)結(jié)合。不過,在大多數(shù)情況下使用的是
間接免疫熒光。它需要兩種抗體,其中第一種(第一抗體)與目標(biāo)蛋白質(zhì)結(jié)合,但本身不帶熒光標(biāo)記。第二種抗體(第二抗體)與第一抗體結(jié)合,專門攜帶熒光染料。間接免疫熒光有幾個優(yōu)點(diǎn)。一方面會產(chǎn)生放大效應(yīng),因?yàn)橥恢挂环N二抗與一抗結(jié)合。另一方面,用相關(guān)熒光染料標(biāo)記的二抗通常比一抗更容易找到。
FITC和TRITC
異硫氰酸熒光素(FITC)是一種有機(jī)熒光染料,目前仍常用于免疫熒光和流式細(xì)胞術(shù)中。它的激發(fā)峰和發(fā)射峰分別為 495 納米和 517 納米,可借助其活性異硫氰酸酯基團(tuán)與蛋白質(zhì)的氨基、巰基、咪唑;、酪氨;螋驶Y(jié)合,從而與不同的抗體偶聯(lián)。FITC 是最早用于熒光顯微鏡的染料之一,也是 ATTO 488、Alexa 488 等其他熒光染料的前身。它的熒光活性源于其自身的大共軛芳香電子結(jié)構(gòu),在藍(lán)色光譜中會被光所激發(fā)。用 ATTO 488 染色的標(biāo)本示例見圖 1。
圖 1:甲醇固定的 MDA-MB-468 細(xì)胞圖像,其中 EGF 受體用 AZ-271 標(biāo)記的 affibody(紅色)染色,Ki67 用抗 Ki67 的兔 IgG(一級)染色,ATTO-647N 標(biāo)記的抗兔的驢 IgG-fab2-片段(二級,藍(lán)色)染色,管蛋白抗體用抗 beta 管蛋白的鼠 IgG(一級)染色,ATTO 488 標(biāo)記的抗鼠的驢 IgG-fab2-片段(二級,綠色)染色、藍(lán)色)、小鼠 IgG 抗 beta 管蛋白抗體染色(一級)和 ATTO 488 標(biāo)記的驢 IgG-fab2-片段抗小鼠抗體染色(二級,綠色)。
經(jīng)常與FITC配合使用的一種染料是同出一門的TRITC(四甲基羅丹明-5-(和6)-異硫氰酸酯)。與 FITC 不同,TRITC 不是熒光素,而是羅丹明家族的衍生物。羅丹明還具有大型共軛芳香電子系統(tǒng),這使其具有熒光特性。TRITC被最大波長為550納米的綠色光譜光激發(fā)。其最大發(fā)射波長為 573 納米。抗體與蛋白質(zhì)的結(jié)合是以活性異硫氰酸酯基團(tuán)為基礎(chǔ)的。
盡管 FITC 和 TRITC 仍被廣泛使用,但由于它們的光穩(wěn)定性低、水溶性差,屬于弱熒光染料,因此不建議用于最新顯微鏡檢查。
其他類型的染料
ATTO 染料或標(biāo)簽包括許多親水性熒光染料、熒光淬滅劑以及大斯托克斯偏移和氧化還原染料,它們都用于熒光顯微鏡。有些 ATTO 染料基于基本熒光物質(zhì),如香豆素、羅丹明、羰基羅丹明、噁嗪或吖啶。例如 ATTO 386H、ATTO 465、ATTO 532、ATTO 647N 和 ATTO 680。例如,ATTO 488 的激發(fā)最大波長為 500 納米,發(fā)射最大波長為 520 納米。它的特性與 FITC 相似,但穩(wěn)定性更好,亮度更高,pH 值敏感性更低。用不同 ATTO 染料染色的樣本示例見圖 2 和圖 3。
圖 2:相分離的巨-單拉美柱狀泡(赤道掃描),液相用 ATTO 488-DPE(綠色)標(biāo)記,液相用 ATTO 647N-DOPE(紅色)標(biāo)記。
圖 3:甲醇固定 MDA-MB-468 細(xì)胞,用小鼠 IgG 抗 beta-微管蛋白(一級)和用 ATTO 488 標(biāo)記的驢 IgG-fab2-片段抗小鼠(二級)微管蛋白抗體染色。
DNA/RNA(核酸)染色
有時,科學(xué)家可能需要研究細(xì)胞中的核酸,例如,借助熒光顯微鏡,通過檢測細(xì)胞核來計(jì)數(shù)特定類型的細(xì)胞或確定它們的確切位置。
最常見的DNA染色劑之一是DAPI (4',6-二氨基-2-苯基吲哚),主要與DNA雙螺旋富含A-T的區(qū)域結(jié)合。與未結(jié)合態(tài)相比,DAPI在DNA上的熒光強(qiáng)度增加。它被紫外線激發(fā),最大波長為 358 納米。發(fā)射光譜寬,峰值為461納米。弱熒光也可以檢測到RNA結(jié)合。在這種情況下,發(fā)射轉(zhuǎn)移到500納米。有趣的是,DAPI能夠滲透完整的細(xì)胞膜。因此,該染料既可用于固定細(xì)胞也可用于活細(xì)胞。
其他常用的 DNA 染色劑有
Hoechst 染色。Hoechst 33258、Hoechst 33342 和 Hoechst 34580 都是雙苯并咪唑類化合物,具有夾雜 DNA 中富含腺嘌呤-胸腺嘧啶(A-T)區(qū)域的傾向。與 DAPI 類似,這些染料被紫外光激發(fā),與 DNA 結(jié)合時在 455 納米處有發(fā)射最大值(未結(jié)合時為 510 至 540 納米)。Hoechst 染色劑具有細(xì)胞滲透性,因此可用于固定細(xì)胞和活細(xì)胞。此外,它們的毒性也低于 DAPI。
碘化丙啶是一種膜滲透性 DNA 染色劑,通常用于區(qū)分細(xì)胞培養(yǎng)中的活細(xì)胞和死細(xì)胞,因?yàn)樗鼰o法進(jìn)入完整的細(xì)胞。碘化丙啶也是一種插層劑,但對不同的堿沒有結(jié)合偏好。在與核酸結(jié)合的狀態(tài)下,它的激發(fā)最大波長為 538 納米,發(fā)射最高波長為 617 納米。未結(jié)合的碘化丙啶激發(fā)和發(fā)射最大值向低波長和低強(qiáng)度移動。它也可以在不改變其熒光特性的情況下與RNA結(jié)合。要區(qū)分 DNA 和 RNA,必須使用適當(dāng)?shù)暮怂崦浮?br />
吖啶橙是一種無需任何修飾就能區(qū)分 DNA 和 RNA 的染料。與 DNA 結(jié)合時,其激發(fā)/發(fā)射最大對波長為 502 nm/525 nm;與 RNA 結(jié)合時,其激發(fā)/發(fā)射最大對波長為 460 nm/650 nm。此外,該染料還可以進(jìn)入酸性間室中,如溶酶體。陽離子染料在酸性間室中質(zhì)子化。在這種酸性環(huán)境中,吖啶橙受藍(lán)色光譜中的光激發(fā),而橙色區(qū)域的發(fā)射最強(qiáng)。該染料通常用于識別凋亡細(xì)胞,因?yàn)榈蛲黾?xì)胞有很多被吞噬的酸性間室。
間室與細(xì)胞器特異性染料
有許多特定的染料可用于研究細(xì)胞區(qū)室,如溶酶體、內(nèi)體或液泡(存在于酵母中,如 S. cerevisiae)以及細(xì)胞器,如線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng) (ER)、高爾基體和細(xì)胞核。圖 4 和圖 5 舉例說明。
細(xì)胞區(qū)室和細(xì)胞器可使用 ATTO-TEC 公司的抗體標(biāo)記試劑盒進(jìn)行染色 [3]?茖W(xué)家可以利用多克隆和單克隆 IgG 抗體或其他蛋白質(zhì)(如 ATTO 488 和 ATTO 643 結(jié)合物)對標(biāo)本進(jìn)行有效標(biāo)記。
在研究蛋白質(zhì)分泌時,通常會對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)進(jìn)行染色。DiOC6(3) [3,3′-二己基氧雜羰花青碘化物]是染色該細(xì)胞器的一種經(jīng)典染料,它是一種綠色熒光親脂性染料,可滲透細(xì)胞并偏愛 ER 膜[4]。不過,它仍能與線粒體等其他細(xì)胞器的膜結(jié)合 [4]。
還可以借助于對細(xì)胞中不同位置有偏好的蛋白質(zhì)來染色感興趣區(qū)域。這種方法的一個例子是小麥胚芽凝集素(WGA)的使用,它與存在于質(zhì)膜中的唾液酸和N-乙酰氨基葡萄糖基特異結(jié)合。
圖 4:小鼠小腦皮層三重標(biāo)記矢狀切片中的浦肯野細(xì)胞或神經(jīng)元。圖像中,紅色表示鈣賓蛋白-D28k 鈣結(jié)合蛋白(抗鈣賓蛋白-D28k/Cy3),綠色表示神經(jīng)膠質(zhì)纖維酸性蛋白(GFAP)[抗 GFAP/Cy5],藍(lán)色表示細(xì)胞核(Hoechst 33258)。
圖 5:用 DAPI(細(xì)胞核,藍(lán)色)、抗-α-tubulin-ATO 488(微管,綠色)和抗-TOMM20-ATO 643(線粒體,紅色)染色的 U2OS 人 骨肉瘤 細(xì)胞。圖像采用共聚焦顯微鏡拍攝。
間室與細(xì)胞器特異性染料
許多重要的細(xì)胞過程,包括細(xì)胞器和囊泡運(yùn)動、細(xì)胞運(yùn)動、細(xì)胞分裂、細(xì)胞分裂、細(xì)胞信號傳導(dǎo)和維持細(xì)胞形狀,都涉及肌動蛋白。
肌動蛋白是一組球狀多功能蛋白質(zhì),構(gòu)成細(xì)胞骨架中的微絲。可用于所有 ATTO 染料的類膠體素共軛物可為肌動蛋白絲的染色和可視化提供強(qiáng)有力的工具[3]。
磷脂在細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能中發(fā)揮著重要作用。磷脂具有兩親性,能夠形成脂質(zhì)雙分子層,因此是構(gòu)成生物膜(如血漿膜和細(xì)胞內(nèi)膜)的主要成分。磷脂等標(biāo)記膜探針是研究細(xì)胞的有用工具。
結(jié)構(gòu)、脂質(zhì)代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、跨膜擴(kuò)散等。ATTO-TEC 公司提供多種磷脂,這些磷脂以甘油為基礎(chǔ),帶有一個或兩個脂肪酸(親油基團(tuán))和一個磷酸鹽單酯殘基(親水基團(tuán)),磷酸鹽單酯殘基可進(jìn)行熒光標(biāo)記[3]。例如,1,2-二棕櫚酰-sn-甘油-3-磷脂酰乙醇胺(DPPE)、1,2-二肉豆蔻酰-sn-甘油-3-磷脂酰乙醇胺(DMPE)、1,2-二油酰-sn-甘油-3-磷脂酰乙醇胺(DOPE)、1-palmitoyl-2-hydroxy-snglycero-3-phosphoethanolamine (PPE)、1,2-dilauroyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DLPE)。
離子成像
就神經(jīng)元研究、基因活動或細(xì)胞運(yùn)動而言,研究細(xì)胞中的離子濃度是很有意義的。鈉、鈣、氯或鎂離子對許多不同的細(xì)胞活動有著深刻的影響。通常,
借助熒光標(biāo)記的螯合劑可以捕獲離子,當(dāng)這些螯合劑與適當(dāng)?shù)碾x子結(jié)合時,就會改變自身的光譜特性。標(biāo)記螯合劑的例子有鈣指示劑 fura-2、indo-1、fluo-3、fluo-4 和鈣綠。對于鈉的檢測,通常使用SBFI(鈉結(jié)合苯并呋喃間苯二甲酸鈉)或鈉綠。此外,PBFI(鉀結(jié)合型苯并呋喃間苯二甲酸酯)還能檢測鉀離子。
功能實(shí)驗(yàn)
“功能實(shí)驗(yàn)”是一個統(tǒng)稱,指的是
評估各種功能的標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn),這些功能可以用熒光標(biāo)志物進(jìn)行可視化觀察。這些標(biāo)記物可以包括但不限于上述任何標(biāo)記技術(shù)和熒光團(tuán)。ATTO-TEC 可為許多功能檢測提供染色試劑盒,可輕松應(yīng)用于各種標(biāo)本。這些試劑盒利用多克隆和單克隆 IgG 抗體或其他帶有 ATTO 染料的蛋白質(zhì) [3]。功能檢測的一個例子就是眾所周知并被廣泛使用的活體/死體檢測。兩個熒光團(tuán)分別用于標(biāo)記活細(xì)胞和死細(xì)胞。在同時掌握這兩個值的情況下,就可以評估細(xì)胞的總體健康狀況。將這些信息與其他標(biāo)記聯(lián)系起來,甚至可以加深對任何潛在過程的了解。
熒光染料的激發(fā)峰和發(fā)射峰是什么?
使用熒光染料時,必須注意其激發(fā)和發(fā)射波長峰、溶解性、量子產(chǎn)率、亮度和光穩(wěn)定性。根據(jù)具體應(yīng)用,應(yīng)使用適當(dāng)?shù)娜玖。熒光染料及其各自的激發(fā)和發(fā)射波長峰的完整列表見下表(PDF 文件)。關(guān)于熒光的基本原理[5],如與熒光染料激發(fā)光和發(fā)射光之間的波長差有關(guān)的斯托克斯偏移,讀者可參閱參考文獻(xiàn) 4。請注意,峰值是每種染料獨(dú)特的激發(fā)光譜和發(fā)射光譜的一部分。在一次實(shí)驗(yàn)中選擇幾種染料同時使用時(如用于多路復(fù)用和空間生物學(xué)應(yīng)用),研究人員應(yīng)注意由于串?dāng)_或滲漏造成的激發(fā)和發(fā)射光譜重疊,這可能導(dǎo)致假陰性或假陽性,或以其他方式使數(shù)據(jù)模糊不清。細(xì)胞和組織中的天然熒光蛋白或生物大分子產(chǎn)生的自發(fā)熒光也會使熒光成像失真。在進(jìn)行植物或藻類實(shí)驗(yàn)時,尤其需要考慮到這一點(diǎn)。不過,如果使用激發(fā)波長長于 550 nm 的染料,可以減少自發(fā)熒光造成的干擾。充分了解染料光譜也很重要,這樣才能對激發(fā)光源(如 LED、弧光燈或激光線)以及發(fā)射濾光器和探測器做出最佳選擇。ATTO 染料光譜[3]示例見下圖 6。有關(guān) ATTO 染料的激發(fā)和發(fā)射波長峰、溶解度、量子產(chǎn)率、亮度和光穩(wěn)定性的信息和數(shù)據(jù),請參閱參考文獻(xiàn) 2。
圖 6:ATTO 488(綠色曲線)和 ATTO 553H(黃色曲線)的熒光發(fā)射曲線?梢郧宄乜吹絻蓚發(fā)射光譜的重疊。紅線表示 488 發(fā)射濾波器的波段。
參考文獻(xiàn):
1、C.Greb, J. DeRose, Introduction to Fluorescent Proteins:光譜和光度特性概述, Leica Microsystems 科學(xué)實(shí)驗(yàn)室 (2023)。
2、K.Horisawa, 利用點(diǎn)擊化學(xué)對生物分子進(jìn)行特異性和定量標(biāo)記,F(xiàn)ront.Physiol.2014 秒系統(tǒng)生物學(xué)檔案,第 5 卷第 5 條。20160677. 請勿:10.3389/fphys.2014.00457.
3、目錄,熒光標(biāo)簽和染料,ATTO-TEC (2024/2025) Leica Microsystems。
4、A.J. Koning、P.Y. Lum、J.M. Williams、R. Wright,DiOC6 染色顯示活酵母細(xì)胞的細(xì)胞器結(jié)構(gòu)和動力學(xué),《細(xì)胞運(yùn)動和細(xì)胞骨架》(1993 年),第 25 卷,第 2 期。2, pp:10.1002/cm.970250202.
5、W.Ockenga, J. DeRose, An Introduction to Fluorescence:光致發(fā)光現(xiàn)象背后的基本理論--熒光和磷光,科學(xué)實(shí)驗(yàn)室(2023 年)徠卡微系統(tǒng)。
相關(guān)產(chǎn)品
STELLARIS共聚焦顯微鏡平臺