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基于生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)( GAN )的根系圖像修復(fù)模型EU-GAN提升修復(fù)效果研究

瀏覽次數(shù):681 發(fā)布日期:2025-10-10  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
分享華中農(nóng)業(yè)大學(xué)“青年長(zhǎng)江”團(tuán)隊(duì)碩士生第一作者在頂級(jí)期刊《 Artificial Intelligence  in Agriculture 》(IF=12.7)  發(fā)表的一篇題為《 EU-GAN :  A  root  inpainting    network   for improving   2D soil-cultivated root phenotyping》的研究論文。團(tuán)隊(duì)已畢業(yè)碩士生謝尚源和已畢業(yè)博士生施家偉為論文共同第一作者,楊萬能教授和廣西大學(xué)李保奇副教授為共同通訊作者。

根盒法因其成本低、非破壞性等優(yōu)點(diǎn),成為獲取土培條件下高通量根系表型數(shù)據(jù)的常用手段,廣受研究者青睞。然而,由于部分根系深藏于土壤中無法被完整采集,導(dǎo)致所獲表型數(shù)據(jù)存在偏差,影響根系形態(tài)參數(shù)計(jì)算的準(zhǔn)確性。同時(shí),根系修復(fù)任務(wù)的標(biāo)注與根系分割一樣,面臨標(biāo)注困難、成本高的挑戰(zhàn),F(xiàn)有修復(fù)方法多依賴算法生成的虛擬根系圖像(包括人工構(gòu)造的根系結(jié)構(gòu)和模擬的缺失區(qū)域),并通過局部裁剪方式進(jìn)行訓(xùn)練,難以有效應(yīng)對(duì)長(zhǎng)距離缺失或根系邊緣區(qū)域的修復(fù)問題,泛化能力有限。
 
針對(duì)上述問題,研究團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了一個(gè)完全開源的混合根系修復(fù)數(shù)據(jù)集(Hybrid Root Inpainting Dataset, HRID)。該數(shù)據(jù)集在大量真實(shí)土培根系圖像標(biāo)注的基礎(chǔ)上,創(chuàng)新性地結(jié)合水培根盒獲取的完整根系圖像與算法模擬的缺失模式,生成兼具真實(shí)性和多樣性的修復(fù)樣本。HRID共包含8922張根系圖像,其中土培根系1206張,水培根系7716張;诖藬(shù)據(jù)集,團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步提出了一種基于生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)( GAN )的EU-GAN模型。通過在生成器中引入邊緣注意力模塊(Edge Attention Module,    EAM)、優(yōu)化損失函數(shù)設(shè)計(jì)并結(jié)合后處理策略,顯著提升了根系修復(fù)效果。實(shí)驗(yàn)表明,該方法將棉花根系的修復(fù)率從17.35%提高至35.75%,關(guān)鍵表型參數(shù)(如根長(zhǎng)、分枝數(shù)等)提取誤差降低了48.64%至88.28%,顯著提升了根系表型分析的精度與可靠性。
 
圖1 技術(shù)路線圖
 
圖2 EU-GAN網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖
 
圖3 EU-GAN修復(fù)效果比較
 
圖4 EU-GAN在不同種類作物根系圖像上的泛化性測(cè)試
發(fā)布者:武漢谷豐光電科技有限公司
聯(lián)系電話:13163362695
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標(biāo)簽: EU-GAN HRID 根系修復(fù)
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