羅氏454測(cè)序儀用于抗生素相關(guān)哮喘研究
454測(cè)序儀用于抗生素相關(guān)哮喘研究
加拿大的科學(xué)家最近在EMBO發(fā)表文章1，發(fā)現(xiàn)萬(wàn)古霉素抗生素會(huì)增加幼鼠的哮喘易感性。這一研究結(jié)果與之前的“衛(wèi)生假設(shè)理論”（hygiene hypothesis）相一致，認(rèn)為腸道內(nèi)微生物菌落中益生菌的缺乏是導(dǎo)致哮喘發(fā)生的原因之一。
過(guò)敏性哮喘影響著全球約1億人口，并且患者數(shù)量與日俱增，尤其是在工業(yè)發(fā)達(dá)國(guó)家的兒童中的患病率上升。不斷提高的衛(wèi)生狀況以及抗生素使用的普及被認(rèn)為是過(guò)敏性哮喘增加的可能原因。此次研究中，不同年齡組的小鼠口服抗生素后，分析其腸道微生物菌落組成與外因引起的過(guò)敏性哮喘的關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，幼年小鼠 在口服萬(wàn)古霉素抗生素后，腸道內(nèi)細(xì)菌的種類減少，菌群組成明顯改變，同時(shí)對(duì)于人為外因的敏感性增強(qiáng)，更易發(fā)生哮喘。
早期的腸道菌群被認(rèn)為對(duì)于免疫力的形成有重大影響，腸道內(nèi)寄生有無(wú)數(shù)細(xì)菌，種類超過(guò)1000種。如果腸道內(nèi)細(xì)菌的平衡被打破，機(jī)體抵抗疾病的能力便會(huì)受到影響。此次研究證明，口服萬(wàn)古霉素會(huì)對(duì)腸道內(nèi)的部分菌種產(chǎn)生選擇壓力，致使免疫調(diào)節(jié)能力、免疫應(yīng)答反應(yīng)受到影響。在幼鼠早期的抗生素使用，改變了腸道菌群的組成，加重了哮喘發(fā)生的機(jī)會(huì)。
在對(duì)腸道菌群的研究中，使用了454測(cè)序儀進(jìn)行16S rRNA擴(kuò)增子測(cè)序。69個(gè)樣本的68014條高質(zhì)量測(cè)序序列進(jìn)行Principle Coordinate Analysis分析后，表明萬(wàn)古霉素對(duì)于幼鼠腸道菌落的影響最大。而鏈霉素的影響較小，成年小鼠受到的影響也較幼鼠小。通過(guò)分子實(shí)驗(yàn)對(duì)免疫分子的檢測(cè)，直接鑒定了肺部哮喘的嚴(yán)重程度。
生命早期是哮喘的關(guān)鍵時(shí)期，此時(shí)的腸道微生物菌群可能影響免疫系統(tǒng)對(duì)于過(guò)敏原的反應(yīng)。通過(guò)這類研究將為更好的理解微生物與健康、疾病關(guān)系提供新線索，幫助更好地預(yù)防治療哮喘。
1. Early life antibiotic-driven changes in microbiota enhance susceptibility to allergic asthma. Shannon L. Russell SL, Gold MJ, Hartmann M, Willing BP, Thorson L, Wlodarska M, Gill N, Blanchet MR, Mohn WW, McNagny KM, Finlay BB (2012) EMBO Rep. May 1;13(5):440-7. doi: 10.1038/embor.2012.32.
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