研究人員利用454全基因組測(cè)序有效追蹤肺結(jié)核疫情傳播

瀏覽次數(shù)：3140　發(fā)布日期：2013-2-28　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

利用454技術(shù)進(jìn)行結(jié)核桿菌全基因組測(cè)序有效追蹤疫情傳播

眾所周知，肺結(jié)核多數(shù)是由結(jié)核分枝桿菌感染肺部引起的肺部感染性疾病，已成為一個(gè)嚴(yán)重威脅人類健康的疾病。世界衛(wèi)生組織（WHO）統(tǒng)計(jì)表明，全世界每年發(fā)生結(jié)核病800～1000萬，每年約有300萬人死于結(jié)核病，是造成死亡人數(shù)最多的單一傳染病。1993年WHO宣布“全球結(jié)核病緊急狀態(tài)”，認(rèn)為結(jié)核病已成為全世界重要的公共衛(wèi)生問題。我國(guó)是世界上結(jié)核疫情最嚴(yán)重的國(guó)家之一。

然而細(xì)菌也一直處于不斷突變及進(jìn)化的過程中，要對(duì)癥下藥就需要知道細(xì)菌的準(zhǔn)確分型。傳統(tǒng)的細(xì)菌分型技術(shù)僅針對(duì)細(xì)菌的某幾個(gè)基因進(jìn)行檢測(cè)，在傳染病疫情爆發(fā)時(shí)往往缺乏更具體的信息，于是在全基因組測(cè)序費(fèi)用不斷下降的現(xiàn)在，研究者們也在嘗試用新一代的檢測(cè)技術(shù)對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分型，以發(fā)現(xiàn)傳染病爆發(fā)的傳播模式和幾率。

近期，據(jù)《PLoS Medicine》雜志報(bào)道，有研究者們利用454技術(shù)對(duì)86例人結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行了全基因組測(cè)序，并與傳統(tǒng)分型技術(shù)結(jié)果進(jìn)行了比較。這86例細(xì)菌是從1997年和2010年兩次爆發(fā)的2301個(gè)結(jié)核病患者身上分離出來的。通過新一代測(cè)序技術(shù)的檢測(cè)結(jié)果，研究者們表示，全基因組測(cè)序法揭示了第一次結(jié)合爆發(fā)所分離的人結(jié)核分枝桿菌不屬于最近爆發(fā)的結(jié)合桿菌傳播鏈，另外通過計(jì)算估計(jì)出人結(jié)核分枝桿菌每2.5年會(huì)發(fā)生1個(gè)發(fā)生突變，這表明細(xì)菌在感染的人群中倍增的時(shí)間為22小時(shí)或每年400代，因此，只有通過全基因組測(cè)序進(jìn)行細(xì)菌分型才能夠提供準(zhǔn)確的關(guān)于結(jié)核分枝桿菌爆發(fā)的相關(guān)流行病信息。

參考文獻(xiàn)：Roetzer A, Diel R, Kohl TA, Ru¨ckert C, Nu¨bel U, et al. (2013) Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of aMycobacterium tuberculosisOutbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study. PLoS Med 10(2): e1001387. doi:10.1371/journal.pmed.1001387

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