SPT Labtech宣布與Thermo Fisher Scientific合作，推出低成本自動(dòng)化NGS建庫(kù)解決方案

文庫(kù)制備成本在如今大規(guī)模的NGS研究費(fèi)用中所占的比重越來(lái)越重，經(jīng)費(fèi)和成本的限制阻礙了科學(xué)家對(duì)傳染病監(jiān)測(cè)、癌癥研究等領(lǐng)域更深入探索的步伐。SPT Labtech宣布與Thermo Fisher Scientific進(jìn)行市場(chǎng)合作，旨在構(gòu)建自動(dòng)化的文庫(kù)制備方案，以期提高建庫(kù)成功率，并降低variant檢測(cè)的費(fèi)用。
 

高靈敏度的variant檢測(cè)現(xiàn)在可以通過(guò)使用SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統(tǒng)進(jìn)行自動(dòng)化建庫(kù)，將反應(yīng)體系微縮化，減少試劑使用量，降低1/10的成本，從而能夠在一組樣本中添加更多的replicates，提高建庫(kù)成功率和測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量。
 
此項(xiàng)方案將首先支持用于Illumina系統(tǒng)的Invitrogen Collibri全基因組測(cè)序文庫(kù)制備試劑盒，以及Collibri文庫(kù)定量試劑盒，包括SARS-CoV-2研究、癌癥研究中拷貝數(shù)變異以及其他突變檢測(cè)的應(yīng)用。
 
更高的效率
SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統(tǒng)可以快速編程，24/7全天候進(jìn)行樣本制備工作，解放研究人員的時(shí)間。
 

圖：dragonfly discovery、mosquito HV genomics 及NGS實(shí)驗(yàn)set up專(zhuān)用軟件

 
更高的成功率
使用SPT Labtech設(shè)備進(jìn)行微縮化建庫(kù)，可將試劑的用量體積減少多達(dá)10倍，從而可以用不到1個(gè)樣本的成本，做5–6個(gè)replicates。樣本重復(fù)數(shù)量的增加，保障了即使某個(gè)樣品在flow cell上測(cè)序失敗，仍有其他樣品的數(shù)據(jù)可以使用，無(wú)需再重新準(zhǔn)備樣本展開(kāi)測(cè)序，從而確保了實(shí)驗(yàn)一次成功。Invitrogen Collibri NGS文庫(kù)制備試劑盒中每種試劑含有一種示蹤染料，通過(guò)顏色變化可清晰觀察文庫(kù)制備過(guò)程，避免高代價(jià)的實(shí)驗(yàn)失誤。
 

圖：dragonfly discovery每個(gè)通道可以獨(dú)立進(jìn)行試劑分配

 
更微量的樣本
SPT Labtech設(shè)備獨(dú)有的固相置換技術(shù)可以精確地處理微量液體，對(duì)0.5uL的粘稠樣本都有著極高的加樣精度。Invitrogen Collibri全基因組測(cè)序文庫(kù)制備試劑盒可從1 ng的樣本起始量提供均勻的基因組覆蓋度。Collibri ES DNA PCR-free建庫(kù)方案經(jīng)過(guò)優(yōu)化，可將 100 ng DNA 制備成足量測(cè)序文庫(kù)，足以用于文庫(kù)定量及在 Illumina NovaSeq 系統(tǒng)上進(jìn)行兩次以上測(cè)序。PCR-free的建庫(kù)流程可在1.5小時(shí)內(nèi)完成，一天內(nèi)就可以將DNA轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù)，從而最大限度地提高實(shí)驗(yàn)效率。
 

圖：mosquito HV genomics的8/16通道進(jìn)行樣本和index轉(zhuǎn)移

 
加速科學(xué)發(fā)現(xiàn)：提高實(shí)驗(yàn)成功率并降低研究成本
SPT Labtech 的產(chǎn)品戰(zhàn)略總監(jiān)Joby Jenkins表示，在不犧牲結(jié)果質(zhì)量的前提下降低NGS建庫(kù)成本是朝著科學(xué)民主化邁出的一大步。NGS技術(shù)發(fā)展迅速，對(duì)于每個(gè)實(shí)驗(yàn)室來(lái)說(shuō)，將最新的建庫(kù)方法進(jìn)行自動(dòng)化的流程搭建將會(huì)非常耗時(shí)，而我們的目標(biāo)就是實(shí)現(xiàn)NGS建庫(kù)過(guò)程的自動(dòng)化和微縮化，解決技術(shù)和方法上的挑戰(zhàn)，這樣科學(xué)家們就可以更關(guān)注于科學(xué)問(wèn)題本身，擴(kuò)大他們研究項(xiàng)目的范圍，最終對(duì)生命科學(xué)和人類(lèi)健康產(chǎn)生更深刻的見(jiàn)解。
 
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