小趣在前面的推文中給大家介紹過(guò)VIP scores圖通過(guò)Metaboanalyst(MA)網(wǎng)站來(lái)實(shí)現(xiàn)的方法，那MA網(wǎng)站是一個(gè)什么樣的網(wǎng)站呢？今天小趣就來(lái)為您介紹~

Metaboanalyst是一個(gè)基于網(wǎng)絡(luò)、功能全面的工具，用于處理、分析和解釋代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。它不僅可以做統(tǒng)計(jì)分析，還能進(jìn)行功能注釋分析，比如Enrichment Analysis、Pathway Analysis。小趣今天主要帶大家來(lái)學(xué)習(xí)一下用Metaboanalyst網(wǎng)站實(shí)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)分析，下面一起來(lái)看看吧~

第一列sample為樣本名，第二列classid為樣本分組，從第3列開始為每一個(gè)代謝物在單個(gè)樣本上的含量。

1.首先在瀏覽器中輸入網(wǎng)址https://www.metaboanalyst.ca/，點(diǎn)擊首頁(yè)Statistical Analysis[one factor]，進(jìn)入下一頁(yè)面，會(huì)有很多數(shù)據(jù)輸入格式選擇，這里我們選擇的輸入格式為.csv，點(diǎn)擊Choose選擇輸入的文件，然后點(diǎn)擊Submit進(jìn)入下一個(gè)頁(yè)面。

2. Edit Groups是修改分組，這里我們不需要修改，直接點(diǎn)擊Proceed進(jìn)入下一個(gè)頁(yè)面。

3. 這個(gè)頁(yè)面是對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，Sample normalization是否對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化處理；Data transformation 是否對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行某種轉(zhuǎn)換；Data scaling 是否對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行某種scaling方式處理。選擇完成后點(diǎn)擊normalize，然后點(diǎn)擊Proceed進(jìn)入下一個(gè)頁(yè)面。

4. 這個(gè)頁(yè)面有很多分析可以進(jìn)行選擇，可根據(jù)自己的需求點(diǎn)擊，比如我們現(xiàn)在需要做一個(gè)PCA，則可以點(diǎn)擊Principal Component Analysis (PCA)，進(jìn)入下一個(gè)頁(yè)面。

5. 在該頁(yè)面可以根據(jù)圖形頁(yè)面的小畫筆對(duì)圖形進(jìn)行修改。這樣我們一張PCA圖就做好啦。最后所有做過(guò)的分析都可以直接通過(guò)左下角的Download直接打包下載。

最后在這里展示幾張通過(guò)該網(wǎng)站做出來(lái)的幾個(gè)分析圖吧。