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Fiber-seq技術(shù):利用HiFi測序?qū)崿F(xiàn)多組學(xué)檢測

瀏覽次數(shù):736 發(fā)布日期:2025-8-26  來源:PacBio微信公眾號

來自華盛頓大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了Fiber-seq 技術(shù),通過非特異性N6- 腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶(m6A-MTase)將單個(gè)染色質(zhì)纖維的結(jié)構(gòu) “標(biāo)記” 在 DNA 模板上,結(jié)合PacBio HiFi測序,實(shí)現(xiàn)了 kilobase 級染色質(zhì)纖維的核苷酸分辨率分析,該項(xiàng)研究成果于2020年發(fā)表于Science雜志


Fiber-seq 設(shè)計(jì)巧妙,其技術(shù)優(yōu)勢體現(xiàn)在:

1)由于腺嘌呤在真核生物中幾乎無內(nèi)源性甲基化,且分布均勻(每2個(gè)堿基1個(gè)),避免 CpG/GpC 的“聚類”和“沙漠化”問題;
2)實(shí)現(xiàn)單分子水平的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析,而非群體平均值;
3)結(jié)合 PacBio HiFi 測序,實(shí)現(xiàn)單個(gè)DNA分子多次重復(fù)測序,保證堿基識別準(zhǔn)確性(包括修飾堿基);
4)提供單倍型的檢測結(jié)果;
5)一次測序可以獲得基因組信息,5mC CpG島信息和染色質(zhì)可及性信息,多維度挖掘基因組隱藏的價(jià)值;
6)無需 bisulfite 轉(zhuǎn)化,減少DNA 降解,結(jié)果重現(xiàn)性好。

Fiber-seq檢測染色質(zhì)可及性原理

 
Fiber-seq 與DNasel-seq和AdMTase-seq的結(jié)果比較,其標(biāo)記分布與 DNase-seq結(jié)果高度一致。

實(shí)驗(yàn)證明Fiber-seq可以應(yīng)用于哺乳動物,昆蟲和植物,擁有廣泛的物種普遍性。未來隨著PacBio HiFi測序讀長和通量的提升,F(xiàn)iber-seq有望成為解析全基因組單倍型調(diào)控,同時(shí)映射遺傳序列和染色質(zhì)狀態(tài)的標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)方法。


PacBio將會參加8月21-25日在四川成都都江堰舉辦的2025表觀遺傳與染色質(zhì)生物學(xué)大會。如您對HiFi測序和Fiber-seq感興趣,歡迎您來PacBio展位(特2展位)交流和咨詢。

關(guān)于PacBio

PacBio (納斯達(dá)克股票代碼:PACB) 是一家領(lǐng)先的生命科學(xué)技術(shù)公司,致力于設(shè)計(jì)、開發(fā)和制造先進(jìn)的測序解決方案,幫助科學(xué)家和臨床研究人員解決復(fù)雜的遺傳問題。我們的產(chǎn)品和技術(shù)源自兩項(xiàng)高度差異化的核心技術(shù),專注于準(zhǔn)確性、質(zhì)量和完整性,包括我們的HiFi長讀長測序和我們的 SBB® 短讀長測序技術(shù)。我們的產(chǎn)品為廣泛的研究應(yīng)用提供解決方案,包括人類生殖系測序、植物和動物科學(xué)、傳染病和微生物學(xué)、腫瘤學(xué)和其他新興應(yīng)用。欲了解更多信息,請?jiān)L問www.pacbio.cn。

*PacBio 產(chǎn)品僅供研究使用,不用于臨床診斷。


關(guān)于怡美通德

北京怡美通德科技發(fā)展有限公司成立于2003年,專業(yè)從事生命科學(xué)領(lǐng)域的儀器設(shè)備和試劑代理分銷以及相關(guān)技術(shù)服務(wù),多年來通過與多個(gè)國際著名生物技術(shù)產(chǎn)品制造商的合作建立了完善的營銷渠道與服務(wù)體系。我們是一家專注于生命科學(xué)領(lǐng)域的綜合性方案提供商,致力于通過代理分銷高質(zhì)量的生命科學(xué)產(chǎn)品和提供先進(jìn)的生物技術(shù)服務(wù),推動生命科學(xué)研究和應(yīng)用的發(fā)展。我們擁有一支專業(yè)、高效的團(tuán)隊(duì),以及廣泛的合作網(wǎng)絡(luò)和資源,能夠?yàn)榭蛻籼峁┤轿、一站式的解決方案。

北京怡美通德科技發(fā)展有限公司是PacBio的官方授權(quán)代理商,如果您想了解更多關(guān)于PacBio的信息,歡迎通過如下方式聯(lián)系我們:

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