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四種轉(zhuǎn)錄組測序樣品的常溫保存方法及優(yōu)勢介紹

瀏覽次數(shù):268 發(fā)布日期:2026-2-6  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負
轉(zhuǎn)錄組測序樣品的常溫保存—RNAsafety



高質(zhì)量的生物樣品是組學(xué)研究尤其是轉(zhuǎn)錄組學(xué)和個性化醫(yī)療過程中臨床檢驗順利實施的前提。生物樣品的保存方式關(guān)系到待檢樣品的質(zhì)量和檢測的結(jié)果。樣品的適當(dāng)?shù)奶幚、保存方式是最終獲取準(zhǔn)確測定結(jié)果必不可少的一環(huán)。常溫保存能耗少,環(huán)保,效費比較高,是一種有潛力的生物樣品保存方式。

相信給位老師在樣品保存方面也存在不少困擾,小編就給您講講生物樣品的常溫保存方法。

目前生物樣品的常溫保存主要有以下四種方式:
1.福爾馬林固定石蠟包埋(formalin-fixed paraffin embedded, FFPE)保存
。該方法是對動物組織及其所包含的生物大分子進行常溫保存的較常用的方法。它可使生物大分子發(fā)生交聯(lián),加上后續(xù)的脫水步驟,整個過程破壞了引起核酸和蛋白等大分子降解的酶類的活性,因而被包埋的組織可以在常溫下保存。由于福爾馬林有致癌性,且容易使核酸片段化,目前該方法保存的樣本對轉(zhuǎn)錄組測序的應(yīng)用不太友好。采用干式化學(xué)穩(wěn)定基質(zhì)(包括高分子基質(zhì))也可以保存核酸。

2.FTA (Flinders Technology Associates)濾紙保存。FTA濾紙是一種多孔的纖維素基質(zhì),經(jīng)由尿酸、非離子表面活性劑或強力變性劑以及螯合劑浸泡處理。當(dāng)樣品加到濾紙上時,細胞被裂解,核酸被釋放出來,吸附在濾紙上。濾紙上的化學(xué)物質(zhì)可使蛋白變性,酶活性喪失。載有核酸的FTA濾紙經(jīng)干燥,可以常溫保存核酸長達數(shù)年。

3.冷凍干燥然后進行常溫保存。水分是降解酶類作用的條件之一。凍干可去除樣品中的水分,因而抑制酶的作用。以上方法雖然可以對生物樣本進行常溫保存,但是在樣本處理方法,RNA保存質(zhì)量上都有劣勢。

第4種方法也是我們今天介紹的主角:組織保護液保存。這是一種簡便易行的生物樣品處理和保存方式,特別適用于動物組織樣品的短期處置。一些硫酸鹽類,在由緩沖劑調(diào)節(jié)的適當(dāng)?shù)膒H值范圍內(nèi),可使某些核酸酶活性降低或喪失,從而保護大分子不被降解。這類穩(wěn)定液,可以迅速滲透組織和細胞,抑制核酸酶活性。將切下來的組織迅速切成尺寸不大于0.5cm的小塊,沒入5-10倍的穩(wěn)定液中。對于RNA來說,樣品可置于室溫(25℃)保存一周,4℃保存一月,-20℃長期保存。當(dāng)需要分離核酸時,將組織從穩(wěn)定液中取出,按常規(guī)進行后續(xù)操作即可。
 

上海伯豪生物技術(shù)有限公司開發(fā)出的RNAsafetyTM組織RNA保存液,可用于這種類型的保存。

 

圖1.第一類醫(yī)療器械備案
實驗顯示,它對組織中RNA的保護效果明顯(見圖2)。采用RNAsafetyTM這類穩(wěn)定液,無需采用液氮或干冰轉(zhuǎn)送和運輸組織,便于操作,也節(jié)省材料費和運輸費。是值得采用的一種樣品處理和保存方式。

圖2. 用上海伯豪的RNAsafetyTM組織保存液保存大鼠肝臟組織(藍、紅、綠表示三個復(fù)本)。室溫放置兩周時,指示RNA完整性的RIN值仍在合格線(紅線)以上。

發(fā)布者:上海伯豪生物技術(shù)有限公司
聯(lián)系電話:021-58760087
E-mail:market@shbio.com

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