來自華盛頓大學的研究團隊開發(fā)了Fiber-seq 技術(shù),通過非特異性N6- 腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶(m6A-MTase)將單個染色質(zhì)纖維的結(jié)構(gòu) “標記” 在 DNA 模板上,結(jié)合PacBio HiFi測序,實現(xiàn)了 kilobase 級染色質(zhì)纖維的核苷酸分辨率分析,該項研究成果于2020年發(fā)表于Science雜志。

Fiber-seq 設(shè)計巧妙,其技術(shù)優(yōu)勢體現(xiàn)在:
1)由于腺嘌呤在真核生物中幾乎無內(nèi)源性甲基化,且分布均勻(每2個堿基1個),避免 CpG/GpC 的“聚類”和“沙漠化”問題;
2)實現(xiàn)單分子水平的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析,而非群體平均值;
3)結(jié)合 PacBio HiFi 測序,實現(xiàn)單個DNA分子多次重復(fù)測序,保證堿基識別準確性(包括修飾堿基);
4)提供單倍型的檢測結(jié)果;
5)一次測序可以獲得基因組信息,5mC CpG島信息和染色質(zhì)可及性信息,多維度挖掘基因組隱藏的價值;
6)無需 bisulfite 轉(zhuǎn)化,減少DNA 降解,結(jié)果重現(xiàn)性好。
Fiber-seq檢測染色質(zhì)可及性原理


Fiber-seq 與DNasel-seq和AdMTase-seq的結(jié)果比較,其標記分布與 DNase-seq結(jié)果高度一致。
實驗證明Fiber-seq可以應(yīng)用于哺乳動物,昆蟲和植物,擁有廣泛的物種普遍性。未來隨著PacBio HiFi測序讀長和通量的提升,F(xiàn)iber-seq有望成為解析全基因組單倍型調(diào)控,同時映射遺傳序列和染色質(zhì)狀態(tài)的標準實驗方法。
PacBio將會參加8月21-25日在四川成都都江堰舉辦的2025表觀遺傳與染色質(zhì)生物學大會。如您對HiFi測序和Fiber-seq感興趣,歡迎您來PacBio展位(特2展位)交流和咨詢。
關(guān)于PacBio
PacBio (納斯達克股票代碼:PACB) 是一家領(lǐng)先的生命科學技術(shù)公司,致力于設(shè)計、開發(fā)和制造先進的測序解決方案,幫助科學家和臨床研究人員解決復(fù)雜的遺傳問題。我們的產(chǎn)品和技術(shù)源自兩項高度差異化的核心技術(shù),專注于準確性、質(zhì)量和完整性,包括我們的HiFi長讀長測序和我們的 SBB® 短讀長測序技術(shù)。我們的產(chǎn)品為廣泛的研究應(yīng)用提供解決方案,包括人類生殖系測序、植物和動物科學、傳染病和微生物學、腫瘤學和其他新興應(yīng)用。欲了解更多信息,請訪問www.pacbio.cn。
*PacBio 產(chǎn)品僅供研究使用,不用于臨床診斷。

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