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高同源SNP分型-多重長片段PCR打斷建庫技術

瀏覽次數(shù):317 發(fā)布日期:2025-11-25  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
同源區(qū)域中的單核苷酸多態(tài)性在遺傳學研究中發(fā)揮著至關重要的作用。然而,由于基因組中存在重復序列,對這些SNP進行基因分型頗具挑戰(zhàn)性,需要采用特定的方法。
翼和生物技術團隊開發(fā)的多重長片段PCR打斷建庫技術可以高效且準確地進行SNP基因分型而免受高同源區(qū)段影響(Lu, M., Li, J., Sun, X., Zhao, D., Zong, H., Tang, C., Li, K., Zhou, Y., & Xiao, J. (2024). Genotyping single nucleotide polymorphisms in homologous regions using multiplex kb level amplicon capture sequencing. Molecular genetics and genomics : MGG, 299 1, 99 .)。這是一種新型的中通量技術,“多重”——在一個反應管中,一次性捕獲10個左右特異性片段。“長片段”——能擴增出5k-10k片段,跨過高同源區(qū),讀到目的片段核苷酸的完整序列。捕獲之后可以通過二代高通量測序大幅度提升獲得高同源區(qū)段SNP精準信息的能力。此外,這也代表多重長片段技術所需樣本消耗更少,更節(jié)約成本。
高同源區(qū)段SNP技術流程圖
 
高同源區(qū)段SNP應用多重長PCR捕獲建庫技術,完美結合了長PCR和多重PCR,吸收了兩種方法的優(yōu)點,首次挑戰(zhàn)并建立了一種新的靶向捕獲建庫二代測序的方案,具有5大優(yōu)勢:長PCR跨同源區(qū)捕獲,大區(qū)間低成本覆蓋,少量樣本經(jīng)濟性,復雜變異檢測,實驗周期明顯縮短。
 
發(fā)布者:上海翼和應用生物技術有限公司
聯(lián)系電話:021-33559491
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