細胞作為生命活動的基本單位,并非孤立存在。在復雜的生物系統(tǒng)中,細胞間通過精密的“通訊網(wǎng)絡”實現(xiàn)信息傳遞,調(diào)控增殖、分化、凋亡等關鍵生理過程,而通訊紊亂往往與腫瘤、自身免疫病等多種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關。解析細胞通訊的分子機制與調(diào)控規(guī)律,已成為生命科學與醫(yī)學研究的核心方向之一,而多技術融合的研究策略正為這一領域帶來突破性進展。
一、 細胞通訊的核心原理:配體-受體介導的信號傳遞
Armingol E, Officer A, Harismendy O, Lewis NE. Deciphering cell-cell interactions and communication from gene expression. Nat Rev Genet. 2021 Feb;22(2):71-88.
細胞通訊的本質(zhì)的是配體-受體特異性互作引發(fā)的信號傳導過程。細胞通過分泌細胞因子、趨化因子、生長因子等配體分子,與靶細胞表面的對應受體結(jié)合,進而啟動細胞內(nèi)下游信號通路,最終調(diào)控靶細胞的生理或病理功能。根據(jù)信號傳遞的空間范圍與方式,細胞通訊主要分為自分泌(Autocrine)、旁分泌(Paracrine)、鄰分泌(Juxtacrine)和內(nèi)分泌(Endocrine)等類型,不同類型的通訊模式共同構(gòu)成了維持組織穩(wěn)態(tài)、調(diào)控免疫應答、驅(qū)動發(fā)育分化的復雜網(wǎng)絡。 這一過程的核心邏輯在于“特異性識別”與“功能傳導”:配體與受體的精準結(jié)合確保了信號傳遞的特異性,而下游信號通路的激活則將分子信號轉(zhuǎn)化為細胞的功能性應答,是連接分子機制與生物表型的關鍵橋梁。
二、 細胞通訊研究的核心挑戰(zhàn)與解決方案
在實際研究中,樣本量少、細胞異質(zhì)性高、通訊過程的空間依賴性等問題,為精準解析細胞通訊模式帶來了諸多挑戰(zhàn)。針對這些痛點,LabEx整合多技術平臺,構(gòu)建了“從轉(zhuǎn)錄組篩選到蛋白組驗證、從單細胞解析到空間定位”的完整研究體系,為細胞通訊研究提供全方位解決方案。
(一)突破細胞異質(zhì)性與樣本限制:單細胞測序技術
對于細胞異質(zhì)性高、樣本量稀缺的研究場景(如腫瘤組織、罕見病樣本),傳統(tǒng) bulk 測序難以區(qū)分不同細胞亞群的通訊特征。單細胞測序(scRNA-seq)技術通過捕獲單個細胞的基因表達譜,能夠精準區(qū)分細胞亞群,篩選出不同亞群特異性表達的差異配體/受體基因,從而挖掘潛在的細胞間通訊分子。例如,在腫瘤微環(huán)境研究中,可通過單細胞測序識別腫瘤細胞與免疫細胞之間特異性表達的配體-受體對,為解析腫瘤免疫逃逸機制提供關鍵線索。

Armingol E, Officer A, Harismendy O, Lewis NE. Deciphering cell-cell interactions and communication from gene expression. Nat Rev Genet. 2021 Feb;22(2):71-88.
(二)還原真實通訊場景:空間多組學技術
細胞通訊具有顯著的“位置依賴性”,僅明確分子互作還不足以還原真實的生理或病理狀態(tài)?臻g轉(zhuǎn)錄組/蛋白組技術能夠定位細胞在組織中的空間分布,明確通訊細胞間的物理關聯(lián),將分子互作與空間位置相結(jié)合。這一技術在腫瘤微環(huán)境、神經(jīng)突觸通訊等研究中尤為重要,可揭示“哪些細胞在特定位置發(fā)生通訊”,從而更真實地還原通訊網(wǎng)絡的組織架構(gòu)。
(三)夯實分子機制:多維度驗證技術
轉(zhuǎn)錄組水平的配體-受體篩選存在假陽性風險,且基因表達并不完全等同于蛋白功能。因此,蛋白水平的驗證是確認細胞通訊真實性的關鍵環(huán)節(jié):
多因子檢測技術(Luminex/MSD/ELISA):具備高靈敏度、高通量優(yōu)勢,可同步檢測多種配體-受體的蛋白表達水平,直接佐證其功能互作;
空間蛋白互作技術(PLA) :實現(xiàn)了內(nèi)源蛋白互作的原位可視化與定量,通過1000倍信號放大效應,適配微量、低豐度樣本,完美保留蛋白互作的原位保真度;
流式細胞術:可高效分選特定細胞亞群并進行表型鑒定,為后續(xù)通訊分析提供高純度的細胞樣本,確保研究的針對性與準確性。
三、 從分子機制到疾病表型:細胞通訊研究的完整鏈路
細胞通訊研究的最終目標是揭示“分子互作-信號通路-疾病表型”的關聯(lián),為疾病診斷與治療提供新靶點;贚abEx多技術平臺,可構(gòu)建標準化的研究流程:
1. 篩選差異分子:整合單細胞與空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),定位疾病相關的差異表達配體/受體,鎖定核心通訊分子;
2. 驗證蛋白功能:通過多因子檢測、PLA等技術,在蛋白水平驗證配體-受體的表達與互作,排除轉(zhuǎn)錄組假陽性,夯實分子機制基礎;
3. 關聯(lián)臨床表型:結(jié)合臨床樣本的腫瘤分期、預后、藥物響應等表型數(shù)據(jù),通過生物信息學分析構(gòu)建完整的關聯(lián)鏈,明確細胞通訊紊亂在疾病發(fā)生發(fā)展中的核心作用。 這一研究鏈路實現(xiàn)了從“發(fā)現(xiàn)分子”到“驗證功能”再到“臨床轉(zhuǎn)化”的閉環(huán),為疾病機制研究與靶向藥物開發(fā)提供了強有力的技術支撐。
四、 LabEx多技術平臺:賦能細胞通訊研究全場景
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技術平臺 |
核心作用 |
適用場景 |
技術優(yōu)勢(LabEx亮點) |
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單細胞測序(scRNA-seq) |
捕獲單個細胞基因表達譜,篩選差異配體 / 受體 |
細胞異質(zhì)性高、樣本量少的研究 |
精準區(qū)分細胞亞群,挖掘潛在通訊分子 |
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空間多組學(空間轉(zhuǎn)錄組 / 蛋白組) |
定位細胞空間分布,明確通訊細胞間物理關聯(lián) |
需解析 “位置依賴型” 通訊(如腫瘤微環(huán)境) |
關聯(lián)空間位置與分子互作,還原真實通訊場景 |
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多因子檢測(Luminex/MSD/ELISA) |
驗證配體 - 受體蛋白水平表達與互作 |
蛋白水平驗證、多分子同步檢測 |
高靈敏度、高通量,直接佐證功能互作(避免轉(zhuǎn)錄組假陽) |
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空間蛋白互作(PLA) |
原位可視化、定位及定量內(nèi)源蛋白互作 |
微量 / 低豐度樣本、內(nèi)源蛋白互作檢測 |
原位保真 + 高特異性 + 1000 倍信號放大,適配多類型樣本 |
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流式細胞術 |
細胞亞群分選與表型鑒定 |
特定細胞亞群分離、純度驗證 |
高效分選目標細胞,支持后續(xù)通訊分析 |
為滿足不同研究需求,LabEx整合五大核心技術平臺,提供靈活定制的研究方案: 從單細胞水平的分子篩選到空間維度的原位驗證,從轉(zhuǎn)錄組到蛋白組的跨層面解析,LabEx多技術平臺覆蓋了細胞通訊研究的全流程,能夠為科研人員提供從實驗設計到數(shù)據(jù)解讀的一站式服務。 細胞通訊網(wǎng)絡的解析是破解生命奧秘、攻克疾病難題的關鍵一步。隨著單細胞測序、空間多組學、多因子檢測等技術的不斷革新與融合,我們對細胞通訊機制的理解正在從“宏觀”走向“微觀”,從“推測”走向“實證”。LabEx始終致力于生命科學的發(fā)展,助力科研人員在生命科學與醫(yī)學領域取得更多突破性成果。如需進一步了解技術細節(jié)或定制研究方案,歡迎隨時咨詢!
樂備實是國內(nèi)專注于提供高質(zhì)量蛋白檢測以及組學分析服務的實驗服務專家,自2018年成立以來,樂備實不斷尋求突破,公司的服務技術平臺已擴展到單細胞測序、空間多組學、流式檢測、超敏電化學發(fā)光、Luminex多因子檢測、抗體芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫組化、DSP空間多組學等30多個,建立起了一套涵蓋基因、蛋白、細胞以及組織水平實驗的完整檢測體系。