概要
VPS4B(液泡蛋白分選相關(guān)蛋白4B)是減數(shù)分裂亞群AAA ATP酶家族(meiotic clade AA ATPase)成員,該類酶以寡聚體形式發(fā)揮功能,通過ATP水解驅(qū)動蛋白轉(zhuǎn)運。VPS4B在某些癌癥中過表達,且與其同源蛋白VPS4A存在合成致死關(guān)系,使VPS4B成為具有潛力的治療靶點。本研究開發(fā)了一種基于VPS4B抑制劑的篩選與分析技術(shù)平臺。該平臺的核心是結(jié)合Transcreener® ADP2 Assay與SPT Labtech dragonfly® discovery非接觸式加樣技術(shù)進行ATP酶活性測定,旨在通過流程優(yōu)化,最大限度減少實驗的不穩(wěn)定,確保篩選結(jié)果的可靠且準(zhǔn)確。
我們采用Transcreener® ADP2 FP成功檢測了VPS4B ATP酶的初始活性,在100 nM酶濃度條件下,總偏振位移約150 mP。借助dragonfly® discovery平臺進行分液操作,在384孔板和1536孔板中測得的Z'因子分別高于0.9和0.8。針對1280種生物活性化合物進行的初步篩選顯示陽性率為1%,干擾率為0.1%。其中一個陽性化合物在后續(xù)的劑量反應(yīng)復(fù)篩實驗中得到了進一步的驗證,且手動分液與dragonfly® discovery系統(tǒng)測得的IC50值高度一致。 本研究證明,SPT Labtech的dragonfly® discovery與Transcreener® ADP2 Assay聯(lián)用,可為VPS4B抑制劑研發(fā)提供了一個穩(wěn)定便捷的技術(shù)平臺。
dragonfly® discovery多功能分液工作站
圖1. dragonfly discovery是一款基于固相置換原理的非接觸式微量分液器
SPT Labtech 開發(fā)的dragonfly discovery分液系統(tǒng)能夠在200 nL至4 mL的超寬量程范圍內(nèi),實現(xiàn)高度精準(zhǔn)且可重復(fù)的非接觸式分液,即便處理高粘度試劑依然表現(xiàn)出色,適用于各類SBS標(biāo)準(zhǔn)微孔板(包括384孔和1536孔板)。其基于固相置換技術(shù)的零校準(zhǔn)、低維護設(shè)計,可快速完成儀器配置與實驗流程(protocol)設(shè)定,尤其適用于微縮化高通量篩選(HTS)。該系統(tǒng)不僅有助于節(jié)約珍貴試劑與耗材,還能有效提升檢測體系的穩(wěn)定性和數(shù)據(jù)可靠性。
其最多配備10個通道,每個通道既可完全獨立運行,又可同步操作,從而實現(xiàn)快速且高度靈活的非接觸式分液。這種設(shè)計不僅支持在高密度1536孔板中進行復(fù)雜的試劑梯度組合以完成方法學(xué)開發(fā)和驗證,也能進行常規(guī)試劑的高通量和快速分裝。
Transcreener®ADP2 Assay檢測方法

圖2. Transcreener ADP2 Assay是一種基于遠紅光的競爭性檢測方法,
通過定量ADP生成量來測定酶活性
Transcreener®檢測技術(shù)基于高度特異性抗體,在均相反應(yīng)體系中直接識別與定量核苷酸,并通過遠紅外熒光輸出檢測信號。Transcreener®檢測專為高通量篩選設(shè)計,采用單次加樣、混勻即讀的實驗?zāi)J剑邆鋬?yōu)異的試劑穩(wěn)定性,且兼容各類主流多功能酶標(biāo)儀品牌。該檢測平臺提供熒光偏振(FP)、熒光強度(FI)及時間分辨熒光能量共振轉(zhuǎn)移(TR-FRET)三種檢測模式。相較于依賴間接測量或多步操作的ADP檢測方法,Transcreener®流程更簡化,具備更高的靈敏度與信噪比。其“加樣混勻即讀”的實驗?zāi)J,結(jié)合試劑穩(wěn)定的性能表現(xiàn),使其尤其適用于自動化工作流程的整合與應(yīng)用。
該技術(shù)采用簡潔高效的實驗原理,并使用了一種特異性識別ADP而非ATP的抗體及遠紅光熒光示蹤劑。反應(yīng)中生成的ADP與熒光示蹤劑競爭結(jié)合抗體,通過改變熒光特性輸出可讀信號。
基于ADP2 FP方法的VPS4B活性酶檢測

圖3. 實驗驗證
A. 在含有8 μM ATP的酶活檢測緩沖液A(50 mM HEPES pH 7.5、10 mM MgCl2、50 mM KCl、5 mM DTT、0.01% Triton)中,分別通過手動移液和dragonfly® discovery平臺對VPS4B蛋白進行梯度稀釋,并在37℃條件下孵育2小時。B. 將酶活性轉(zhuǎn)換為ADP生成量后擬合成標(biāo)準(zhǔn)曲線,證實手動移液與dragonfly® discovery分液所測得的酶活反應(yīng)速率具有良好的一致性。
基于ADP2 FP方法的Z'因子測定

圖4. 手動和dragonfly discovery實驗結(jié)果比較
在12個數(shù)據(jù)點上,分別用384孔板(A)與1536孔板(B)測定了Z'因子。上半部分圖表展示手動移液操作的Z’因子值;下半部分圖表則為通過 dragonfly® discovery 分液所得的Z’因子值。
VPS4B酶抑制劑初篩

圖5. VPS4B ATP酶預(yù)實驗篩選
采用Transcreener® ADP2 FP檢測法對Tocris 2.0化合物庫中的1280個化合物進行篩選,共鑒定出13個偏振值高于3倍標(biāo)準(zhǔn)差的潛在抑制劑;其中12個化合物對檢測體系無干擾效應(yīng)。
劑量反應(yīng)曲線和IC50分析

圖6. 劑量反應(yīng)分析
A. 從初篩中獲得的陽性化合物ESI-09及對照化合物Suramin的劑量反應(yīng)曲線,實驗在384孔板中進行。其中,對照化合物Suramin的IC50值在手動移液和 dragonfly® discovery 平臺上分別是B. 2.3 μM和C. 2.9 μM。
結(jié)論
Transcreener® ADP2檢測技術(shù)采用均相熒光偏振法,可實現(xiàn)VPS4B酶活性的直接定量測定。
該技術(shù)與SPT Labtech的dragonfly® discovery平臺聯(lián)用后,該檢測體系展現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量(Z'因子持續(xù)高于0.8,信號窗口穩(wěn)定),為高通量篩選流程提供了可靠支撐。
在384孔板和1536孔板中的驗證實驗表明,dragonfly® discovery與Transcreener®檢測技術(shù)具有良好的板型適應(yīng)性,在不同規(guī)格微孔板中均表現(xiàn)出高度可重復(fù)的穩(wěn)定性能。
自動化非接觸式分液功能顯著簡化了酶滴定、方法學(xué)開發(fā)及化合物庫篩選等操作流程,有效提升了實驗通量與數(shù)據(jù)穩(wěn)定性。
初步篩選研究進一步驗證了該檢測體系在藥物研發(fā)中的適用性,成功鑒定出多個VPS4B抑制劑并測得其IC50值,結(jié)果可靠,充分展現(xiàn)了該方案在VPS4B及相關(guān)ATP酶研究中的應(yīng)用潛力。