
在CRISPR篩選、蛋白工程和合成生物學(xué)等前沿領(lǐng)域,實(shí)驗(yàn)規(guī)模的擴(kuò)大正在快速推動DNA合成技術(shù)升級。
Twist Bioscience基于其硅基DNA合成平臺,構(gòu)建了從寡核苷酸到完整基因的三層級“池化(pool)產(chǎn)品體系”,用于支持不同復(fù)雜度的高通量研究。
01 寡核苷酸池(Oligo Pools) 高通量篩選的基礎(chǔ)構(gòu)建單元
Oligo pool是Twist利用硅基 DNA 編寫技術(shù)合成的高度多樣化的單鏈寡核苷酸集合。Twist合成平臺能夠在每次運(yùn)行中大規(guī)模并行生產(chǎn)成千上萬個高質(zhì)量、高精度的寡核苷酸,從而生成復(fù)雜多樣的寡核苷酸池,用于CRISPR篩選等應(yīng)用。
核心參數(shù)
• 交付:ssDNA干粉
• 長度:可達(dá)350 nt
• 規(guī)模:無最低/最高數(shù)量限制
• 均一性:>90%序列在2倍均值范圍內(nèi)
• 錯誤率:平均 1:3000 nt
• 可用核苷酸:A、T、C、G、N
典型應(yīng)用
• CRISPR gRNA文庫
• 反轉(zhuǎn)子文庫重組工程(RLR)
• 大規(guī)模并行報(bào)告基因檢測(MPRA)
• 熒光原位雜交
• 空間組學(xué)的Oligopaint探針
• 基因組tiling (如抗原掃描, STARR-Seq)
• 多肽庫 (如蛋白質(zhì)工程)
• 細(xì)胞條形碼
• shRNA
• DNA數(shù)據(jù)存儲
• 多重自動基因組工程(MAGE)

02 多重基因片段(Multiplexed Gene Fragments, MGF)從寡核苷酸到功能片段的躍遷
多基因片段庫由用戶序列合成,每個基因片段的長度最多為500bp。這些序列最初被合成為長度不超過500bp的寡核苷酸池,然后在dsDNA中進(jìn)行擴(kuò)增,并以多基因片段庫的形式提供,這些片段經(jīng)過仔細(xì)分析,以確保池中 > 90% 的基因長度正確。該產(chǎn)品針對快速、高通量篩選應(yīng)用進(jìn)行了優(yōu)化。
核心參數(shù)
• 交付:dsDNA干粉(>200ng)
• 長度:301-500bp(可變區(qū)約 460 bp)
• 規(guī)模:無最低/最高數(shù)量限制
• 均一性:>90%序列在3倍均值范圍內(nèi)
• 錯誤率:平均 1:2000 nt
• 質(zhì)量控制:>90%為正確長度片段
典型應(yīng)用
• 引導(dǎo)編輯
• 基于超復(fù)雜CRISPR的功能篩選
• 肽和蛋白質(zhì)工程
• 抗體發(fā)現(xiàn)
• 大規(guī)模并行報(bào)告基因分析(MPRA)

03 基因池(Gene Pools)完整基因級別的高通量構(gòu)建
基因池是匯集基因合成的革命性突破。行業(yè)獨(dú)有的無嵌合體匯集基因組裝平臺,可將寡核苷酸池組裝成長度從 300bp至1.8 kb的基因池,為序列設(shè)計(jì)提供充足的空間。
核心參數(shù)
• 交付:dsDNA干粉 (標(biāo)準(zhǔn)10ug)
• 長度范圍:300 bp – 1.8 kb
• 錯誤率:約 1:3000
• chimera rate:0%
• dropout rates:<1%
• 均一性:95/5th percentile ≤10
• 質(zhì)量控制:>90%為正確長度片段
典型應(yīng)用
• AI 模型基因序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建
• 單鏈抗體片段(scFvs)庫
• T 細(xì)胞受體(TCR)免疫庫研究
• 現(xiàn)有方法難以實(shí)現(xiàn)的大規(guī)模序列篩選

TWIST——引領(lǐng)DNA合成
從寡核苷酸到完整基因文庫,Twist Bioscience正在推動DNA合成進(jìn)入規(guī);c系統(tǒng)化階段,為高通量篩選與合成生物學(xué)研究提供關(guān)鍵基礎(chǔ)設(shè)施。
您可以利用更多的高性能工具來擴(kuò)展您的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。以全新的視角重新審視錯綜復(fù)雜的基因通路、基因組編輯、蛋白質(zhì)工程和精準(zhǔn)醫(yī)療。使用這一全新的DNA合成平臺,釋放合成生物學(xué)和基因組學(xué)的全部潛力。
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