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伯齊講座:NGS核酸片斷化、文庫(kù)構(gòu)建與捕獲自動(dòng)化

瀏覽次數(shù):3593 發(fā)布日期:2016-9-14  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

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背景內(nèi)容

      隨著二代測(cè)序(NGS)技術(shù)的推廣和使用,測(cè)序分析向著高通量、低成本的方向發(fā)展。測(cè)序樣本在上機(jī)進(jìn)行測(cè)序之前,需要對(duì)測(cè)序樣本進(jìn)行前處理。前處理的整個(gè)過(guò)程涉及到核酸的提取和純化,核酸的定量,基因文庫(kù)的構(gòu)建,PCR擴(kuò)增,目的序列的捕獲等多個(gè)操作過(guò)程,過(guò)程十分繁瑣。因此,將樣本前處理的步驟最大程度的自動(dòng)化和高通量化,減少人力的操作時(shí)間,有利于提高工作效率。

      在開(kāi)始測(cè)序前,樣本DNA需要進(jìn)行片段化處理,以符合測(cè)序儀可讀的片斷大小。伯齊科技引入了美國(guó)Microsonics系統(tǒng),可以將DNA片段化工作高通量化,并且還可以選擇片段的大小,從而快速、精確的將樣本DNA片段化。其產(chǎn)生的片斷大小均一,更可省掉后續(xù)的片斷篩選步驟,簡(jiǎn)化樣本處理程序。
      片斷化之后便是測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建和捕獲,這也是測(cè)序樣本前處理的關(guān)鍵但也是最耗時(shí)的步驟。二代測(cè)序過(guò)程中的文庫(kù)構(gòu)建、序列捕獲和純化,涉及到試劑的配制、磁珠的吸附,磁珠的洗滌、純化等操作步驟,十分瑣碎且耗力。法國(guó)Primadiag(派瑪廸格)的全自動(dòng)NGS樣本建庫(kù)捕獲系統(tǒng),為二代測(cè)序過(guò)程中的文庫(kù)構(gòu)建、序列捕獲和純化提供自動(dòng)化解決方案。該系統(tǒng)由于其高度的靈活性,可自動(dòng)化完成包括試劑配制在內(nèi)的各種工作,真正實(shí)現(xiàn)測(cè)序樣本制備自動(dòng)化。系統(tǒng)的智能計(jì)算功能,也使得建庫(kù)和捕獲所使用的實(shí)際試劑消耗達(dá)到最小,并且允許使用最少的槍頭數(shù)來(lái)完成整個(gè)工作,大大節(jié)約試劑和耗材成本。

      這次公開(kāi)課伯齊科技將向您介紹測(cè)序樣本前處理步驟及高通量的全自動(dòng)NGS樣本建庫(kù)捕獲系統(tǒng)。

演講者信息

劉祖梅 (Susie LIU)

香港伯齊科技有限公司 (技術(shù)支持)

醫(yī)學(xué)碩士,2008年畢業(yè)于華中科技大學(xué)。2008年至2015年先后于上海生命科學(xué)研究院和艾伯維醫(yī)藥從事于基礎(chǔ)科學(xué)研究和新藥的早期研發(fā)工作。2016年加入香港伯齊科技有限公司,主要職位為儀器應(yīng)用技術(shù)支持,在二代測(cè)序(NGS)自動(dòng)化應(yīng)用上有很豐富的經(jīng)驗(yàn)。

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