系列講座主題：

主題一：初識(shí)GOLD：GOLD的對(duì)接原理及其性能介紹

主題二：大批量的分子對(duì)接：如何使用GOLD進(jìn)行虛擬篩選

主題三：如何使用GOLD進(jìn)行含有水分子或金屬離子體系的分子對(duì)接
 

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一、初識(shí)GOLD：GOLD的對(duì)接原理及其性能介紹

Basic introduction of GOLD: the genetic algorithm and the performance of GOLD

時(shí)間：11月24日（周四）下午15:00-16:00
 

此次講座您將了解到GOLD的遺傳算法、四種常用的打分函數(shù)等理論知識(shí)，同時(shí)我們將通過(guò)一個(gè)案例分析，為您介紹GOLD分子對(duì)接的流程、關(guān)鍵參數(shù)的設(shè)置及結(jié)果分析的方法。

二、大批量的分子對(duì)接：如何使用GOLD進(jìn)行虛擬篩選

Ultra-large docking: Using GOLD for High throughput virtual screening

時(shí)間：12月08日（周四）下午15:00-16:00 
 

虛擬篩選可以通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬幫助研發(fā)工作人員快速的在海量化合物中篩選出具有目標(biāo)靶蛋白活性的先導(dǎo)化合物，大大節(jié)省了實(shí)驗(yàn)時(shí)間和成本。目前GOLD支持在PC端、HPC集群或云端進(jìn)行大批量虛擬篩選工作，此次講座您將了解到如何使用GOLD進(jìn)行虛擬篩選工作，以及如何進(jìn)行虛擬篩選結(jié)果分析等。

三、如何使用GOLD進(jìn)行含有水分子或金屬離子體系的分子對(duì)接

Docking with and without water using GOLD: Identify the solvated intermediate ligand-protein interaction

時(shí)間：12月22日（周四）下午15:00-16:00 
 

水在蛋白質(zhì)-配體結(jié)合過(guò)程中的作用至關(guān)重要。在基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)中，人們通常對(duì)配體進(jìn)行優(yōu)化以取代蛋白質(zhì)結(jié)合口袋中能量不利的水分子。有些蛋白體系含有金屬離子或金屬離子復(fù)合物比如CPY450酶等，金屬離子能與蛋白或小分子形成配位鍵，但是配位鍵模型在經(jīng)典的力場(chǎng)中比較難以準(zhǔn)確描述。

在GOLD 中憑借CSD 數(shù)據(jù)庫(kù)中大量的含金屬的晶體結(jié)構(gòu)，GOLD對(duì)于金屬離子的相互作用構(gòu)型等有較好理解，因此特別適用于含金屬離子的體系對(duì)接。

此次講座您將了解到如何分析結(jié)合口袋中的水分子和金屬離子的作用，并使用GOLD進(jìn)行含有水分子或金屬離子體系的分子對(duì)接。