目前，驗證全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）顯著位點的能力尚未跟上其發(fā)現(xiàn)的速度——這被稱為“變異到功能之間的鴻溝（variant to function gap）”。功能基因組學(xué)是研究基因功能的金標(biāo)準(zhǔn)，然而，傳統(tǒng)的研究方法往往缺乏空間背景信息。

空間Perturb-Seq（Spatial Perturb-Seq）是一個具有廣泛應(yīng)用前景的平臺，它通過將多重CRISPR擾動與完整體內(nèi)組織的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)相結(jié)合，克服了這一難題。這使得研究者能夠同時考察基因功能對細(xì)胞自身的調(diào)控（細(xì)胞自主性效應(yīng)）以及對周圍環(huán)境或鄰近細(xì)胞的影響（非細(xì)胞自主性效應(yīng)）。

通過使用Xenium原位技術(shù)對組織進(jìn)行分析，我們將其性能與基于測序的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)平臺進(jìn)行了基準(zhǔn)測試，展示了其在檢測通量、靈敏度、準(zhǔn)確性和空間分辨率方面的互補(bǔ)優(yōu)勢。除了對單個細(xì)胞進(jìn)行空間分析外，我們還利用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)在原位繪制了細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)。

本期精彩看點：

• 特邀來自新加坡基因組研究院的Kimberle Shen博士
• ​功能基因組學(xué)中尚未滿足的需求
• 空間Perturb-Seq帶來的關(guān)鍵見解
• 在空間條形碼、譜系追蹤以及疾病模型機(jī)制研究中的未來應(yīng)用
• Xenium原位分析產(chǎn)品的介紹

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