伯齊小講堂：NextGen PCR+MinION快速基因條碼流程

瀏覽次數(shù)：1762　發(fā)布日期：2023-8-9　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

DNA 條碼可用于標(biāo)本樣本的物種級(jí)分類，但很少用于需要在數(shù)小時(shí)內(nèi)估計(jì)物種豐富度或鑒定害蟲或入侵物種的時(shí)間比較緊的項(xiàng)目。主要原因是現(xiàn)有的快速條形碼工作流程要么過于昂貴，要么只能由訓(xùn)練有素的員工在裝備精良的實(shí)驗(yàn)室中執(zhí)行。

本次為大家分享小講堂，介紹了近日德國(guó)萊布尼茨進(jìn)化與生物多樣性科學(xué)研究所的綜合生物多樣性發(fā)現(xiàn)中心研發(fā)的一個(gè)簡(jiǎn)單的工作流程。他們採(cǎi)用HotSHOT對(duì)樣本進(jìn)行快速 DNA 提取、並利用MBS公司的NextGen PCR® 系統(tǒng)進(jìn)行快速基因條碼及擴(kuò)增基因片段，以及使用低成本 MinION 測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序進(jìn)行樣本測(cè)序。最後，他們?cè)?6 小時(shí)內(nèi)為 285 個(gè)標(biāo)本生成和識(shí)別 250 個(gè)基因條碼來展示該方法的強(qiáng)大功能和高效性。他們們認(rèn)為使用簡(jiǎn)化的基因條碼工作流程使現(xiàn)在的物種級(jí)分類可以更快，更準(zhǔn)確，并且具有足夠的成本效益。它應(yīng)該在許多項(xiàng)目中取代形態(tài)物種分類。

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