在“蛋白組學(xué)在臨床科研中的應(yīng)用”這一系列的文章中，我們分享了眼科、內(nèi)分泌、心血管、神經(jīng)等方面的研究思路。今天我們來介紹一個非常重要的，并且離不開蛋白質(zhì)組學(xué)研究的一個學(xué)科——免疫方向的科研套路，哦不，是思路。

話不多說，滿滿干貨！

第一篇，      強直性脊椎炎

雜志：Cts-Clin Transl Sci

時間：2015

IF: 1.052

摘要：這篇文章使用正常對照（9例）和患者（12例）的外周血單核細(xì)胞，利用iTRAQ技術(shù)做兩組之間的差異蛋白比較分析。一共得到1232個蛋白，其中183個表達(dá)有差異。后續(xù)作者挑選CTSG， DFEA3，PTPRC和 PRDX1做Elisa驗證。與對照組相比，CTSG，DEFA3和PTPRC的表達(dá)量都有顯著升高，而PRDX1的表達(dá)量明顯下降。文章的這些發(fā)現(xiàn)可能為研究強直性脊柱炎的發(fā)病機(jī)制提供新的思路。

思路：iTRAQ+Elisa

第二篇，      類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎

雜志：PLOS One

時間：2016

IF: 3.057

摘要：本文使用用藥有反應(yīng)的類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者（R組4例）與用藥沒反應(yīng)的類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者（NR組4例）的血清樣本。通過iTRAQ實驗，共找到264個蛋白，其中有差異表達(dá)的只有9個。其中四個蛋白由于沒有商業(yè)化抗體沒有進(jìn)行Elisa實驗，其余五個均用Elisa試劑盒進(jìn)行了驗證。結(jié)果顯示HPX在R/NR之間有顯著的差異。血清中的蛋白可以作為用藥指導(dǎo)的Biomarker。

思路：iTRAQ+Elisa

第三篇，      持續(xù)性過敏性鼻炎

雜志：Clin Exp Allergy

時間：2016

IF: 5.587

摘要： 本文使用45例持續(xù)過敏性鼻炎患者的血清樣本作為實驗組，20例正常人的血清樣本作為對照。去除14種高峰度蛋白之后，作者使用iTRAQ技術(shù)尋找兩組之間的差異表達(dá)蛋白。一共找到133種。通過Metacore數(shù)據(jù)庫生信分析之后，轉(zhuǎn)錄因子ESR1，STAT1和STAT3被認(rèn)為是非常關(guān)鍵的，其中STAT3可能與A2M的表達(dá)有關(guān)系。接著作者在血清中通過Elisa的方法驗證了A2M的表達(dá)量，同時在鼻粘膜樣本中，通過免疫組學(xué)得到A2M，ESR1，STAT1和STAT3的表達(dá)情況。通過一系列的實驗，作者找到10條與過敏性鼻炎相關(guān)的通路，其中BC通路是最顯著被調(diào)節(jié)的。通路中的A2M在患者中表達(dá)量很高。干預(yù)STAT3-A2M通路可作為今后過敏性鼻炎免疫反應(yīng)中功能研究的方向。

思路：iTRAQ+生信分析+ELISA驗證差異蛋白+免疫熒光/HE染色驗證

第四篇，      銀屑病

雜志：Immunity

時間：2013

IF: 24.082

摘要： 這篇文章樣本來自患者的皮損處及非皮損處表皮，各19例。通過iTRAQ分組比較后，得出1217個蛋白，其中有表達(dá)量差異的有214個。其中以S100A8-A9上調(diào)最為顯著，其次為C3。隨后作者通過構(gòu)建基因敲除鼠發(fā)現(xiàn)，S100A9基因敲除后，小鼠的銀屑病程度減輕。同時，在體內(nèi)干擾C3的表達(dá)量也能減輕病樣表現(xiàn)。作者據(jù)此推測S100A9作為一個染色質(zhì)成分，可能通過結(jié)合C3起始位點的上游區(qū)域來調(diào)節(jié)C3的表達(dá)。因此，S100A8-A9有望成為銀屑病潛在的治療靶點。[

思路：iTRAQ+生信分析+小鼠iTraq+免疫組化+免疫熒光+WB驗證

上述可見，相對定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)以其新穎、性價比高、低門檻得到越來越多關(guān)注，來吉凱挑選適合您的蛋白質(zhì)組學(xué)方案吧！

文末彩蛋，給認(rèn)真看文的你！

各類蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用：