這項重要工作由Jie Wang, Jin Jin, Yuekun Fang, Liting Chen & Peng Fei共同完成,其研究成果以題為《Light sheet microscopy imaging dataset of CAR-T-cell-mediated cytotoxicity》的論文形式,于2026年2月在線發(fā)表于國際知名學術數(shù)據(jù)期刊《Scientific Data》。
重要發(fā)現(xiàn)
本研究的核心貢獻在于構建并應用了一套名為“高通量貝塞爾斜平面顯微鏡”的系統(tǒng),系統(tǒng)性地攻克了活體免疫細胞成像中的多重挑戰(zhàn),并首次生成了一個大規(guī)模、高維度的動態(tài)成像數(shù)據(jù)集。
首先,在光學設計上,它基于斜平面顯微鏡構型。與需要復雜樣品夾持的雙物鏡光片顯微鏡不同,OPM使用單個物鏡同時進行照明和檢測,這使得它可以采用培養(yǎng)皿等傳統(tǒng)、用戶友好的樣品承載方式,極大簡化了懸浮細胞(如CAR-T細胞)的觀測流程。更重要的是,研究團隊采用了雙環(huán)貝塞爾光片照明來優(yōu)化照明光束。傳統(tǒng)高斯光片在軸向分辨率與有效視場之間存在固有的權衡。而通過使用一個經(jīng)過MATLAB仿真優(yōu)化的雙環(huán)掩模對入射高斯光束進行調制,該系統(tǒng)能產(chǎn)生一個側瓣被抑制在40%以下、瑞利范圍超過40微米的準無衍射貝塞爾光束。這種光束形態(tài)確保了在約20微米高的細胞相互作用區(qū)域內,能獲得均勻且超。0.5-1.5微米可調)的光片照明,從而在實現(xiàn)高軸向分辨率的同時,極大地降低了光毒性。
其次,在樣品制備方面,研究團隊設計并制造了一種開頂式微腔陣列芯片。該芯片由2025個直徑和深度均為50微米的圓柱形微腔組成。芯片材料選用折射率與水匹配的Bio-133紫外固化樹脂,有效消除了光片采集時的球差。這種設計巧妙地將懸浮細胞限制在固定的微腔中,解決了其易漂移、聚集的問題,實現(xiàn)了大規(guī)模細胞群體的并行觀察、精確定位和連續(xù)追蹤。
最后,在數(shù)據(jù)采集策略上,研究采用了多尺度時間采樣方案。CAR-T細胞的殺傷過程跨越秒、分鐘、小時三個時間尺度。為在長達5小時的觀測中既捕獲快速動力學(如逆行肌動蛋白流),又維持細胞活性,系統(tǒng)采用了非均勻采樣:對每個感興趣區(qū)域,先以2.5秒間隔高速采集6個體積(覆蓋15秒),隨后讓細胞“休息”10分鐘。這10分鐘的間隔允許活性氧等光毒性產(chǎn)物被代謝清除,從而將傳統(tǒng)OPM或共聚焦系統(tǒng)通常不足10分鐘的T細胞觀測窗口,延長至數(shù)小時。結合自動化批量成像算法,系統(tǒng)每10分鐘可順序掃描40個細胞對,實現(xiàn)了高通量與低生理擾動的最佳平衡。02一個詳盡的數(shù)據(jù)集與自動化分析流程
數(shù)據(jù)集提供了從原始數(shù)據(jù)到分析結果的全鏈條信息。針對OPM成像產(chǎn)生的傾斜原始圖像堆棧,團隊開發(fā)了一套基于仿射變換的三維重建算法,并通過圖形用戶界面集成,方便用戶將傾斜的原始數(shù)據(jù)精確校準、重構成標準的正交三維體積數(shù)據(jù)。
重建后的數(shù)據(jù)被系統(tǒng)地組織,每個觀察區(qū)域包含120個時間點的體積數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)通過多個熒光通道標記了關鍵細胞結構:405納米通道標記死細胞,488納米通道標記CAR-T細胞的肌動蛋白骨架,561納米通道同時標記腫瘤細胞膜和CAR-T細胞的微管結構。為進一步支持高級分析,數(shù)據(jù)集還提供了由3D U-Net生成的自動分割掩膜,將細胞外空間、CAR-T細胞核、靶細胞核、CAR-T細胞質/膜、靶細胞質/膜分別進行標記,便于自動化表型分析和定量研究。03技術驗證與生物學結論
對數(shù)據(jù)集進行定量分析,成功捕捉到了關鍵的生物學表型。以免疫突觸面積和逆行肌動蛋白流速度作為形態(tài)與動力學指標,以腫瘤細胞死亡率作為功能指標,研究發(fā)現(xiàn),經(jīng)達沙替尼處理的CAR-T細胞,其免疫突觸面積顯著減小,逆行肌動蛋白流速度明顯降低,并且靶細胞死亡率也隨之下降。這些變化與已知的達沙替尼抑制細胞毒性的機制高度吻合,不僅證實了該藥物在成像模型中的預期效應,更關鍵地驗證了本數(shù)據(jù)集在生理層面上的高保真度和生物學敏感性。最終結論表明,這套HBOPM成像平臺及其產(chǎn)生的高質量數(shù)據(jù)集,為在亞細胞分辨率下系統(tǒng)性研究CAR-T細胞的動態(tài)殺傷機制提供了強大的工具和資源。
創(chuàng)新與亮點
這項技術所展現(xiàn)的非接觸、快速、可重復的局部磁狀態(tài)改寫能力,在光學生物醫(yī)療領域具有潛在的應用價值。例如,其原理可啟發(fā)新型生物相容性磁微粒的光學操控。設想未來若能開發(fā)出可在生理環(huán)境下被特定波長近紅外激光激發(fā)的磁性生物探針,借鑒本文中的光控拓撲轉變思路,或能實現(xiàn)對標記了磁性納米顆粒的細胞或生物分子進行高精度、無創(chuàng)的光學靶向與操控,用于藥物遞送、細胞分選或高分辨率生物成像。此外,該研究揭示的拓撲穩(wěn)定性與外界場(光、磁)的響應關系,也為設計新型光學響應的生物傳感器提供了物理基礎,通過檢測磁拓撲狀態(tài)的變化來反映微弱的生物化學信號。
本研究的核心創(chuàng)新在于精準地解決了活體、懸浮免疫細胞長期高分辨率成像的業(yè)界難題。傳統(tǒng)共聚焦顯微鏡因嚴重的光毒性,將觀測窗口限制在十分鐘以內;而新興的光片顯微鏡又受困于懸浮細胞樣品制備的挑戰(zhàn)。本研究首創(chuàng)性地將斜平面顯微鏡構型、雙環(huán)貝塞爾光束整形與折射率匹配的微流控芯片三者結合,從光學原理、照明方式到樣品承載實現(xiàn)了協(xié)同創(chuàng)新。其中,雙環(huán)掩模產(chǎn)生的長瑞利范圍貝塞爾光片,是達成高分辨率與低光毒性兼顧的關鍵;而仿生微腔芯片則巧妙地將懸浮細胞動力學研究轉化為“固定化”觀察,實現(xiàn)了高通量、可重復的定位追蹤。
該技術的實際價值在生物醫(yī)學領域尤為突出。它首次使得研究人員能夠以接近真實的生理條件,對CAR-T細胞攻擊腫瘤細胞的“全生命周期”進行長達數(shù)小時的“直播”式觀察,分辨率高達320納米,足以分辨細胞器層面的動態(tài)。這好比為免疫學家提供了一臺超高清、長時間記錄的“細胞行為監(jiān)控器”。其應用場景深遠:在基礎科研中,可用于精確量化免疫突觸的形成、顆粒分泌、細胞凋亡等關鍵事件的動力學參數(shù),揭示新的作用機制;在藥物研發(fā)中,可作為一種強大的表型篩選平臺,定量評估不同藥物或CAR設計對T細胞殺傷效力的實時影響,加速療法優(yōu)化。該研究公開的數(shù)據(jù)集和代碼,將進一步降低該先進成像技術的使用門檻,推動免疫細胞學研究進入一個更精細化、定量化的新時代。
總結與展望
總而言之,這項研究通過開發(fā)高通量貝塞爾斜平面顯微鏡系統(tǒng),成功克服了長期困擾CAR-T細胞動態(tài)觀測的光毒性、分辨率與通量瓶頸,并發(fā)布了首個與之匹配的大規(guī)模、高分辨率四維成像數(shù)據(jù)集。這項工作不僅提供了一套強大的技術工具,更貢獻了一個寶貴的資源庫,極大推動了細胞免疫療法的機制研究向著更精細、更定量的維度發(fā)展。
DOI:10.1038/s41597-026-06829-9.