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多組學精準解析T1D演化:空間依賴的病理鏈條被完整捕獲

瀏覽次數(shù):222 發(fā)布日期:2026-3-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
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文章背景

1型糖尿病(T1D)的發(fā)生發(fā)展通常經(jīng)歷由正常(ND)到自身抗體陽性(AAB+)到臨床確診T1D的逐級演化過程。在這一過程中,胰島β細胞的免疫攻擊與功能衰竭被視為核心病理事件,但不同階段的胰腺細胞類型是否共同參與病程推進、其基因調(diào)控網(wǎng)絡是否發(fā)生方向性重寫或偏移,尚缺乏系統(tǒng)性的空間與多組學證據(jù)。本研究通過單核多組學(snRNA+snATAC)結合CosMx SMI空間轉(zhuǎn)錄組技術,構建多階段T1D的胰腺細胞圖譜,解析驅(qū)動疾病進展的細胞類型特異性基因調(diào)控程序與信號網(wǎng)絡,并揭示潛在的致病關鍵節(jié)點與可干預靶點。

研究技術與樣本設計

本研究納入32例nPOD供體胰腺組織,覆蓋ND(n=11)、ND AAB+(n=9)、近期確診T1D(n=7)及長期T1D(n=5),采用10x單核轉(zhuǎn)錄組(snRNA-seq)與單核染色質(zhì)開放性測序(snATAC-seq)對全胰腺細胞進行表觀調(diào)控與轉(zhuǎn)錄活性聯(lián)合解析,并在部分樣本中應用單核multiome實現(xiàn)轉(zhuǎn)錄-表觀對應分析。同時對6例供體開展CosMx SMI 1k panel空間轉(zhuǎn)錄組檢測

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樣本設計-樣本橫跨病程多階段,實現(xiàn)表型與空間結構隨疾病演化的連續(xù)追蹤

文章結論

1.T1D早期呈現(xiàn)空間生態(tài)位破裂,β細胞呈向高免疫暴露區(qū)域的定向遷移

在AAB+階段,SMI空間成像與snRNA聯(lián)合分析顯示,胰腺整體結構已發(fā)生空間層面的不穩(wěn)定重構:β細胞從正常胰島核心型聚集逐漸向腺泡邊緣、導管周圍及免疫細胞富集區(qū)偏移,形成穩(wěn)定的β–T細胞和β–巨噬細胞鄰域。值得注意的是,這些結構性變化發(fā)生在分泌功能顯著衰退之前,屬于可被空間檢測捕捉到的亞臨床階段早期信號,提示T1D的早期驅(qū)動因素并非首先表現(xiàn)為功能驟降,而是β細胞在空間維度上向高免疫暴露位點的選擇性富集。這一過程為潛在干預提供了早于功能指標改變的空間預警窗口。

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胰腺中可及染色質(zhì)的細胞類型特異性圖譜

2.β細胞在空間暴露背景下發(fā)生免疫可見性提升與表型偏移,先于功能性衰竭出現(xiàn)

在空間生態(tài)位改變后,β細胞進入表型偏移階段:AAB+樣本中已可見抗原呈遞/干擾素通路顯著激活,同時與分泌相關基因(INS、IAPP、GLIS3)同步下降。這種免疫可見性提升與分泌穩(wěn)定性下降的雙向變化,并非在胰腺中均一發(fā)生,而是集中出現(xiàn)在免疫接觸熱點位點,與SMI所揭示的空間熱點區(qū)域一致。隨病程推進,這些局灶區(qū)域逐漸擴展為帶狀/簇狀結構,并在長期T1D階段形成區(qū)域性不可逆功能缺失帶。

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T1D進展中基因表達的細胞類型特異性變化

3.空間依賴的調(diào)控網(wǎng)絡重構與身份偏移標志β細胞進入不可逆衰竭階段

T1D階段β細胞的IRF/STAT/ATF免疫驅(qū)動motif開放性增強,而維持身份與內(nèi)分泌功能的HNF1/RFX/FOXA等關鍵調(diào)控網(wǎng)絡開放性減弱。SMI進一步證實,這一調(diào)控重寫并非內(nèi)源性同步發(fā)生,而是空間依賴的:高IRF1/STAT1活性β細胞主要位于炎癥密集區(qū)、缺氧帶或腺泡邊緣鄰域,而功能保留細胞則多位于空間保護區(qū)。換言之,β細胞的命運并不是被動結果,而是由空間生態(tài)位選擇壓力推動調(diào)控網(wǎng)絡重排,最終促成不可逆細胞身份偏移,成為病程加速和結構性失能形成的關鍵決定因素。

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T1D進展中胰腺細胞類型的表觀基因組變化

文章總結

本研究在多階段T1D供體胰腺中構建了整合轉(zhuǎn)錄組、表觀組與空間定位的多層級圖譜,證實T1D并非單一免疫殺傷β細胞的線性事件,而是β細胞抗原呈遞放大、外分泌協(xié)同失衡、調(diào)控網(wǎng)絡重構、功能不可逆下滑的動態(tài)系統(tǒng)過程。同時,IRF/STAT等上游調(diào)控因子與抗原呈遞/干擾素信號軸構成潛在干預靶點,AAB+階段的提前激活為早期診斷與預防性治療提供了理論依據(jù)。

發(fā)布者:上海生物芯片有限公司
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